Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXS9

CASP12, Inactive caspase-12, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP12Q6UXS9 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASP12Q6UXS9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASP12Q6UXS9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASP12Q6UXS9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASP12Q6UXS9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASP12Q6UXS9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASP12Q6UXS9 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASP12Q6UXS9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASP12Q6UXS9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASP12Q6UXS9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASP12Q6UXS9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASP12Q6UXS9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASP12Q6UXS9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASP12Q6UXS9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASP12Q6UXS9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASP12Q6UXS9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASP12Q6UXS9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASP12Q6UXS9 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASP12Q6UXS9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASP12Q6UXS9 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASP12Q6UXS9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASP12Q6UXS9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASP12Q6UXS9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP12Q6UXS9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP12Q6UXS9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP12Q6UXS9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP12Q6UXS9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP12Q6UXS9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP12Q6UXS9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP12Q6UXS9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP12Q6UXS9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP12Q6UXS9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP12Q6UXS9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP12Q6UXS9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP12Q6UXS9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP12Q6UXS9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP12Q6UXS9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP12Q6UXS9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP12Q6UXS9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP12Q6UXS9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CASP12Q6UXS9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CASP12Q6UXS9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CASP12Q6UXS9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CASP12Q6UXS9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CASP12Q6UXS9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CASP12Q6UXS9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CASP12Q6UXS9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASP12Q6UXS9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASP12Q6UXS9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASP12Q6UXS9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASP12Q6UXS9 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASP12Q6UXS9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASP12Q6UXS9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASP12Q6UXS9 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASP12Q6UXS9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CASP12Q6UXS9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASP12Q6UXS9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CASP12Q6UXS9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CASP12Q6UXS9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASP12Q6UXS9 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASP12Q6UXS9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASP12Q6UXS9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASP12Q6UXS9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASP12Q6UXS9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASP12Q6UXS9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASP12Q6UXS9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASP12Q6UXS9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASP12Q6UXS9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASP12Q6UXS9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASP12Q6UXS9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASP12Q6UXS9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CASP12Q6UXS9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASP12Q6UXS9 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASP12Q6UXS9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASP12Q6UXS9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CASP12Q6UXS9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASP12Q6UXS9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASP12Q6UXS9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASP12Q6UXS9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASP12Q6UXS9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASP12Q6UXS9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASP12Q6UXS9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASP12Q6UXS9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASP12Q6UXS9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASP12Q6UXS9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CASP12Q6UXS9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASP12Q6UXS9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASP12Q6UXS9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASP12Q6UXS9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CASP12Q6UXS9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASP12Q6UXS9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CASP12Q6UXS9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CASP12Q6UXS9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CASP12Q6UXS9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CASP12Q6UXS9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CASP12Q6UXS9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CASP12Q6UXS9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CASP12Q6UXS9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CASP12Q6UXS9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CASP12Q6UXS9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms