Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
ZBED9Q6R2W3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
ZBED9Q6R2W3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
ZBED9Q6R2W3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.57
ZBED9Q6R2W3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.57
ZBED9Q6R2W3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
ZBED9Q6R2W3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
ZBED9Q6R2W3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
ZBED9Q6R2W3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
ZBED9Q6R2W3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
ZBED9Q6R2W3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
ZBED9Q6R2W3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
ZBED9Q6R2W3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
ZBED9Q6R2W3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
ZBED9Q6R2W3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
ZBED9Q6R2W3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
ZBED9Q6R2W3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
ZBED9Q6R2W3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
ZBED9Q6R2W3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
ZBED9Q6R2W3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
ZBED9Q6R2W3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
ZBED9Q6R2W3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
ZBED9Q6R2W3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
ZBED9Q6R2W3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
ZBED9Q6R2W3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
ZBED9Q6R2W3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
ZBED9Q6R2W3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
ZBED9Q6R2W3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC31.08■■■□□ 2.57
ZBED9Q6R2W3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
ZBED9Q6R2W3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
ZBED9Q6R2W3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
ZBED9Q6R2W3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
ZBED9Q6R2W3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
ZBED9Q6R2W3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
ZBED9Q6R2W3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
ZBED9Q6R2W3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
ZBED9Q6R2W3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
ZBED9Q6R2W3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
ZBED9Q6R2W3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
ZBED9Q6R2W3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
ZBED9Q6R2W3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
ZBED9Q6R2W3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
ZBED9Q6R2W3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
ZBED9Q6R2W3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
ZBED9Q6R2W3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
ZBED9Q6R2W3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
ZBED9Q6R2W3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
ZBED9Q6R2W3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
ZBED9Q6R2W3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
ZBED9Q6R2W3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
ZBED9Q6R2W3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
ZBED9Q6R2W3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
ZBED9Q6R2W3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
ZBED9Q6R2W3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
ZBED9Q6R2W3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
ZBED9Q6R2W3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
ZBED9Q6R2W3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
ZBED9Q6R2W3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
ZBED9Q6R2W3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
ZBED9Q6R2W3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
ZBED9Q6R2W3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
ZBED9Q6R2W3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
ZBED9Q6R2W3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
ZBED9Q6R2W3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
ZBED9Q6R2W3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
ZBED9Q6R2W3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
ZBED9Q6R2W3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.56
ZBED9Q6R2W3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
ZBED9Q6R2W3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
ZBED9Q6R2W3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
ZBED9Q6R2W3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
ZBED9Q6R2W3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC31■■■□□ 2.55
ZBED9Q6R2W3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
ZBED9Q6R2W3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
ZBED9Q6R2W3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
ZBED9Q6R2W3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
ZBED9Q6R2W3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
ZBED9Q6R2W3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
ZBED9Q6R2W3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
ZBED9Q6R2W3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
ZBED9Q6R2W3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
ZBED9Q6R2W3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
ZBED9Q6R2W3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
ZBED9Q6R2W3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ZBED9Q6R2W3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ZBED9Q6R2W3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ZBED9Q6R2W3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
ZBED9Q6R2W3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
ZBED9Q6R2W3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
ZBED9Q6R2W3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ZBED9Q6R2W3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ZBED9Q6R2W3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ZBED9Q6R2W3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
ZBED9Q6R2W3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
ZBED9Q6R2W3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
ZBED9Q6R2W3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ZBED9Q6R2W3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ZBED9Q6R2W3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC30.95■■■□□ 2.55
ZBED9Q6R2W3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
ZBED9Q6R2W3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
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