Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIF2

SYCE2, Synaptonemal complex central element protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE2Q6PIF2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYCE2Q6PIF2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYCE2Q6PIF2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYCE2Q6PIF2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SYCE2Q6PIF2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SYCE2Q6PIF2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SYCE2Q6PIF2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYCE2Q6PIF2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYCE2Q6PIF2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYCE2Q6PIF2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYCE2Q6PIF2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYCE2Q6PIF2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYCE2Q6PIF2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYCE2Q6PIF2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYCE2Q6PIF2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYCE2Q6PIF2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYCE2Q6PIF2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYCE2Q6PIF2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYCE2Q6PIF2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYCE2Q6PIF2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYCE2Q6PIF2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYCE2Q6PIF2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYCE2Q6PIF2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYCE2Q6PIF2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYCE2Q6PIF2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYCE2Q6PIF2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYCE2Q6PIF2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYCE2Q6PIF2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYCE2Q6PIF2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYCE2Q6PIF2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYCE2Q6PIF2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYCE2Q6PIF2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYCE2Q6PIF2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SYCE2Q6PIF2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SYCE2Q6PIF2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYCE2Q6PIF2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYCE2Q6PIF2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYCE2Q6PIF2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SYCE2Q6PIF2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYCE2Q6PIF2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYCE2Q6PIF2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYCE2Q6PIF2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYCE2Q6PIF2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYCE2Q6PIF2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYCE2Q6PIF2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYCE2Q6PIF2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYCE2Q6PIF2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYCE2Q6PIF2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYCE2Q6PIF2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYCE2Q6PIF2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SYCE2Q6PIF2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYCE2Q6PIF2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYCE2Q6PIF2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYCE2Q6PIF2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYCE2Q6PIF2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYCE2Q6PIF2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYCE2Q6PIF2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SYCE2Q6PIF2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYCE2Q6PIF2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYCE2Q6PIF2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYCE2Q6PIF2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYCE2Q6PIF2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYCE2Q6PIF2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYCE2Q6PIF2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYCE2Q6PIF2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYCE2Q6PIF2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SYCE2Q6PIF2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYCE2Q6PIF2 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SYCE2Q6PIF2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SYCE2Q6PIF2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYCE2Q6PIF2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYCE2Q6PIF2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SYCE2Q6PIF2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYCE2Q6PIF2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYCE2Q6PIF2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYCE2Q6PIF2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYCE2Q6PIF2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYCE2Q6PIF2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYCE2Q6PIF2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SYCE2Q6PIF2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYCE2Q6PIF2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYCE2Q6PIF2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYCE2Q6PIF2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYCE2Q6PIF2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYCE2Q6PIF2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYCE2Q6PIF2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYCE2Q6PIF2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYCE2Q6PIF2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SYCE2Q6PIF2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYCE2Q6PIF2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYCE2Q6PIF2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYCE2Q6PIF2 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYCE2Q6PIF2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYCE2Q6PIF2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SYCE2Q6PIF2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYCE2Q6PIF2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYCE2Q6PIF2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SYCE2Q6PIF2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYCE2Q6PIF2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYCE2Q6PIF2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.1 ms