Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB30

CSAG1, Putative chondrosarcoma-associated gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1Q6PB30 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CSAG1Q6PB30 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CSAG1Q6PB30 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CSAG1Q6PB30 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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CSAG1Q6PB30 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CSAG1Q6PB30 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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CSAG1Q6PB30 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CSAG1Q6PB30 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CSAG1Q6PB30 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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CSAG1Q6PB30 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CSAG1Q6PB30 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CSAG1Q6PB30 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CSAG1Q6PB30 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CSAG1Q6PB30 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CSAG1Q6PB30 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CSAG1Q6PB30 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CSAG1Q6PB30 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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CSAG1Q6PB30 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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CSAG1Q6PB30 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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CSAG1Q6PB30 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CSAG1Q6PB30 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CSAG1Q6PB30 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CSAG1Q6PB30 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CSAG1Q6PB30 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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CSAG1Q6PB30 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
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CSAG1Q6PB30 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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CSAG1Q6PB30 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CSAG1Q6PB30 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CSAG1Q6PB30 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CSAG1Q6PB30 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CSAG1Q6PB30 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CSAG1Q6PB30 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CSAG1Q6PB30 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CSAG1Q6PB30 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CSAG1Q6PB30 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CSAG1Q6PB30 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CSAG1Q6PB30 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CSAG1Q6PB30 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
CSAG1Q6PB30 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
CSAG1Q6PB30 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
CSAG1Q6PB30 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CSAG1Q6PB30 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CSAG1Q6PB30 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CSAG1Q6PB30 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CSAG1Q6PB30 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CSAG1Q6PB30 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CSAG1Q6PB30 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CSAG1Q6PB30 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CSAG1Q6PB30 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CSAG1Q6PB30 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CSAG1Q6PB30 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CSAG1Q6PB30 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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