Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4E1

CASC4, Protein CASC4, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC4Q6P4E1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CASC4Q6P4E1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CASC4Q6P4E1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CASC4Q6P4E1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CASC4Q6P4E1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CASC4Q6P4E1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CASC4Q6P4E1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CASC4Q6P4E1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CASC4Q6P4E1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CASC4Q6P4E1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CASC4Q6P4E1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CASC4Q6P4E1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CASC4Q6P4E1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CASC4Q6P4E1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CASC4Q6P4E1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CASC4Q6P4E1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CASC4Q6P4E1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CASC4Q6P4E1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CASC4Q6P4E1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CASC4Q6P4E1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CASC4Q6P4E1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CASC4Q6P4E1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CASC4Q6P4E1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CASC4Q6P4E1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CASC4Q6P4E1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CASC4Q6P4E1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CASC4Q6P4E1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CASC4Q6P4E1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CASC4Q6P4E1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CASC4Q6P4E1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CASC4Q6P4E1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CASC4Q6P4E1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CASC4Q6P4E1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CASC4Q6P4E1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CASC4Q6P4E1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CASC4Q6P4E1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CASC4Q6P4E1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CASC4Q6P4E1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CASC4Q6P4E1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CASC4Q6P4E1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CASC4Q6P4E1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CASC4Q6P4E1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CASC4Q6P4E1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CASC4Q6P4E1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CASC4Q6P4E1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASC4Q6P4E1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASC4Q6P4E1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASC4Q6P4E1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASC4Q6P4E1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASC4Q6P4E1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CASC4Q6P4E1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASC4Q6P4E1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CASC4Q6P4E1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASC4Q6P4E1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASC4Q6P4E1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASC4Q6P4E1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CASC4Q6P4E1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CASC4Q6P4E1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CASC4Q6P4E1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CASC4Q6P4E1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CASC4Q6P4E1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CASC4Q6P4E1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CASC4Q6P4E1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CASC4Q6P4E1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CASC4Q6P4E1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CASC4Q6P4E1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CASC4Q6P4E1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CASC4Q6P4E1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CASC4Q6P4E1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CASC4Q6P4E1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CASC4Q6P4E1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CASC4Q6P4E1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CASC4Q6P4E1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CASC4Q6P4E1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CASC4Q6P4E1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CASC4Q6P4E1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CASC4Q6P4E1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CASC4Q6P4E1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CASC4Q6P4E1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CASC4Q6P4E1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CASC4Q6P4E1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CASC4Q6P4E1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CASC4Q6P4E1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CASC4Q6P4E1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CASC4Q6P4E1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CASC4Q6P4E1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CASC4Q6P4E1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CASC4Q6P4E1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CASC4Q6P4E1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CASC4Q6P4E1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CASC4Q6P4E1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CASC4Q6P4E1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CASC4Q6P4E1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CASC4Q6P4E1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CASC4Q6P4E1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CASC4Q6P4E1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CASC4Q6P4E1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CASC4Q6P4E1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CASC4Q6P4E1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CASC4Q6P4E1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms