Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRNP1Q6NT89 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRNP1Q6NT89 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRNP1Q6NT89 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRNP1Q6NT89 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRNP1Q6NT89 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRNP1Q6NT89 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRNP1Q6NT89 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRNP1Q6NT89 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRNP1Q6NT89 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRNP1Q6NT89 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRNP1Q6NT89 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRNP1Q6NT89 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRNP1Q6NT89 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRNP1Q6NT89 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRNP1Q6NT89 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRNP1Q6NT89 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRNP1Q6NT89 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRNP1Q6NT89 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRNP1Q6NT89 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRNP1Q6NT89 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TRNP1Q6NT89 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRNP1Q6NT89 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRNP1Q6NT89 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRNP1Q6NT89 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRNP1Q6NT89 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRNP1Q6NT89 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRNP1Q6NT89 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TRNP1Q6NT89 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRNP1Q6NT89 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRNP1Q6NT89 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRNP1Q6NT89 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRNP1Q6NT89 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRNP1Q6NT89 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TRNP1Q6NT89 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRNP1Q6NT89 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRNP1Q6NT89 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRNP1Q6NT89 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRNP1Q6NT89 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRNP1Q6NT89 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRNP1Q6NT89 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRNP1Q6NT89 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRNP1Q6NT89 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRNP1Q6NT89 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRNP1Q6NT89 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRNP1Q6NT89 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRNP1Q6NT89 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRNP1Q6NT89 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRNP1Q6NT89 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRNP1Q6NT89 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TRNP1Q6NT89 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRNP1Q6NT89 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRNP1Q6NT89 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRNP1Q6NT89 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRNP1Q6NT89 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRNP1Q6NT89 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TRNP1Q6NT89 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRNP1Q6NT89 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRNP1Q6NT89 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRNP1Q6NT89 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRNP1Q6NT89 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRNP1Q6NT89 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRNP1Q6NT89 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRNP1Q6NT89 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRNP1Q6NT89 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRNP1Q6NT89 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRNP1Q6NT89 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRNP1Q6NT89 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRNP1Q6NT89 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TRNP1Q6NT89 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRNP1Q6NT89 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRNP1Q6NT89 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRNP1Q6NT89 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRNP1Q6NT89 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRNP1Q6NT89 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TRNP1Q6NT89 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRNP1Q6NT89 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRNP1Q6NT89 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRNP1Q6NT89 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRNP1Q6NT89 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRNP1Q6NT89 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRNP1Q6NT89 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRNP1Q6NT89 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRNP1Q6NT89 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRNP1Q6NT89 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRNP1Q6NT89 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRNP1Q6NT89 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRNP1Q6NT89 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRNP1Q6NT89 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRNP1Q6NT89 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRNP1Q6NT89 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRNP1Q6NT89 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRNP1Q6NT89 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRNP1Q6NT89 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRNP1Q6NT89 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRNP1Q6NT89 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRNP1Q6NT89 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRNP1Q6NT89 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRNP1Q6NT89 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRNP1Q6NT89 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms