Protein–RNA interactions for Protein: Q6IMN6

CAPRIN2, Caprin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPRIN2Q6IMN6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAPRIN2Q6IMN6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAPRIN2Q6IMN6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAPRIN2Q6IMN6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAPRIN2Q6IMN6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAPRIN2Q6IMN6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAPRIN2Q6IMN6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAPRIN2Q6IMN6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAPRIN2Q6IMN6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAPRIN2Q6IMN6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAPRIN2Q6IMN6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAPRIN2Q6IMN6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAPRIN2Q6IMN6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAPRIN2Q6IMN6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAPRIN2Q6IMN6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAPRIN2Q6IMN6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAPRIN2Q6IMN6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPRIN2Q6IMN6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPRIN2Q6IMN6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPRIN2Q6IMN6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPRIN2Q6IMN6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPRIN2Q6IMN6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPRIN2Q6IMN6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPRIN2Q6IMN6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPRIN2Q6IMN6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPRIN2Q6IMN6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPRIN2Q6IMN6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPRIN2Q6IMN6 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPRIN2Q6IMN6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPRIN2Q6IMN6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPRIN2Q6IMN6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPRIN2Q6IMN6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPRIN2Q6IMN6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPRIN2Q6IMN6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPRIN2Q6IMN6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPRIN2Q6IMN6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPRIN2Q6IMN6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPRIN2Q6IMN6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPRIN2Q6IMN6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPRIN2Q6IMN6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPRIN2Q6IMN6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPRIN2Q6IMN6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPRIN2Q6IMN6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPRIN2Q6IMN6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPRIN2Q6IMN6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPRIN2Q6IMN6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPRIN2Q6IMN6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPRIN2Q6IMN6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPRIN2Q6IMN6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPRIN2Q6IMN6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CAPRIN2Q6IMN6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CAPRIN2Q6IMN6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPRIN2Q6IMN6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPRIN2Q6IMN6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPRIN2Q6IMN6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPRIN2Q6IMN6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPRIN2Q6IMN6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPRIN2Q6IMN6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPRIN2Q6IMN6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPRIN2Q6IMN6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPRIN2Q6IMN6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPRIN2Q6IMN6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPRIN2Q6IMN6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPRIN2Q6IMN6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPRIN2Q6IMN6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPRIN2Q6IMN6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPRIN2Q6IMN6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPRIN2Q6IMN6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPRIN2Q6IMN6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPRIN2Q6IMN6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPRIN2Q6IMN6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPRIN2Q6IMN6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPRIN2Q6IMN6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPRIN2Q6IMN6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPRIN2Q6IMN6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPRIN2Q6IMN6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPRIN2Q6IMN6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPRIN2Q6IMN6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPRIN2Q6IMN6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPRIN2Q6IMN6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPRIN2Q6IMN6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPRIN2Q6IMN6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPRIN2Q6IMN6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPRIN2Q6IMN6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPRIN2Q6IMN6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPRIN2Q6IMN6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPRIN2Q6IMN6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPRIN2Q6IMN6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPRIN2Q6IMN6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPRIN2Q6IMN6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPRIN2Q6IMN6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPRIN2Q6IMN6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPRIN2Q6IMN6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPRIN2Q6IMN6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPRIN2Q6IMN6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPRIN2Q6IMN6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPRIN2Q6IMN6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPRIN2Q6IMN6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPRIN2Q6IMN6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPRIN2Q6IMN6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms