Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI14

SLC9A4, Sodium/hydrogen exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A4Q6AI14 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC9A4Q6AI14 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC9A4Q6AI14 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC9A4Q6AI14 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC9A4Q6AI14 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC9A4Q6AI14 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC9A4Q6AI14 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC9A4Q6AI14 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC9A4Q6AI14 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC9A4Q6AI14 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC9A4Q6AI14 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC9A4Q6AI14 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC9A4Q6AI14 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC9A4Q6AI14 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC9A4Q6AI14 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC9A4Q6AI14 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC9A4Q6AI14 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC9A4Q6AI14 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC9A4Q6AI14 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC9A4Q6AI14 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC9A4Q6AI14 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC9A4Q6AI14 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC9A4Q6AI14 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC9A4Q6AI14 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC9A4Q6AI14 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC9A4Q6AI14 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC9A4Q6AI14 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC9A4Q6AI14 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC9A4Q6AI14 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC9A4Q6AI14 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC9A4Q6AI14 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC9A4Q6AI14 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC9A4Q6AI14 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC9A4Q6AI14 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC9A4Q6AI14 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC9A4Q6AI14 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC9A4Q6AI14 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC9A4Q6AI14 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC9A4Q6AI14 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC9A4Q6AI14 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC9A4Q6AI14 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC9A4Q6AI14 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC9A4Q6AI14 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC9A4Q6AI14 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC9A4Q6AI14 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC9A4Q6AI14 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC9A4Q6AI14 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC9A4Q6AI14 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC9A4Q6AI14 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC9A4Q6AI14 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC9A4Q6AI14 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC9A4Q6AI14 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC9A4Q6AI14 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC9A4Q6AI14 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC9A4Q6AI14 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC9A4Q6AI14 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC9A4Q6AI14 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC9A4Q6AI14 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC9A4Q6AI14 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC9A4Q6AI14 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC9A4Q6AI14 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC9A4Q6AI14 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC9A4Q6AI14 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC9A4Q6AI14 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC9A4Q6AI14 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC9A4Q6AI14 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC9A4Q6AI14 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC9A4Q6AI14 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC9A4Q6AI14 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC9A4Q6AI14 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC9A4Q6AI14 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC9A4Q6AI14 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC9A4Q6AI14 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC9A4Q6AI14 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC9A4Q6AI14 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC9A4Q6AI14 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC9A4Q6AI14 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC9A4Q6AI14 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC9A4Q6AI14 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC9A4Q6AI14 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC9A4Q6AI14 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC9A4Q6AI14 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC9A4Q6AI14 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC9A4Q6AI14 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC9A4Q6AI14 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC9A4Q6AI14 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC9A4Q6AI14 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC9A4Q6AI14 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC9A4Q6AI14 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC9A4Q6AI14 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC9A4Q6AI14 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC9A4Q6AI14 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC9A4Q6AI14 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC9A4Q6AI14 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC9A4Q6AI14 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC9A4Q6AI14 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC9A4Q6AI14 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC9A4Q6AI14 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC9A4Q6AI14 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC9A4Q6AI14 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.6 ms