Protein–RNA interactions for Protein: Q68G74

LHX8, LIM/homeobox protein Lhx8, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX8Q68G74 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LHX8Q68G74 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LHX8Q68G74 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LHX8Q68G74 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LHX8Q68G74 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LHX8Q68G74 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LHX8Q68G74 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LHX8Q68G74 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
LHX8Q68G74 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LHX8Q68G74 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LHX8Q68G74 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LHX8Q68G74 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LHX8Q68G74 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LHX8Q68G74 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LHX8Q68G74 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LHX8Q68G74 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LHX8Q68G74 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LHX8Q68G74 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LHX8Q68G74 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LHX8Q68G74 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
LHX8Q68G74 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LHX8Q68G74 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LHX8Q68G74 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LHX8Q68G74 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LHX8Q68G74 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LHX8Q68G74 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LHX8Q68G74 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LHX8Q68G74 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LHX8Q68G74 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LHX8Q68G74 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LHX8Q68G74 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LHX8Q68G74 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LHX8Q68G74 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LHX8Q68G74 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LHX8Q68G74 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LHX8Q68G74 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
LHX8Q68G74 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LHX8Q68G74 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LHX8Q68G74 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LHX8Q68G74 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LHX8Q68G74 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LHX8Q68G74 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
LHX8Q68G74 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
LHX8Q68G74 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
LHX8Q68G74 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
LHX8Q68G74 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LHX8Q68G74 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LHX8Q68G74 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LHX8Q68G74 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LHX8Q68G74 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LHX8Q68G74 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LHX8Q68G74 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LHX8Q68G74 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LHX8Q68G74 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LHX8Q68G74 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LHX8Q68G74 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LHX8Q68G74 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LHX8Q68G74 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LHX8Q68G74 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LHX8Q68G74 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LHX8Q68G74 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
LHX8Q68G74 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
LHX8Q68G74 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LHX8Q68G74 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LHX8Q68G74 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LHX8Q68G74 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LHX8Q68G74 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LHX8Q68G74 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LHX8Q68G74 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LHX8Q68G74 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
LHX8Q68G74 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LHX8Q68G74 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LHX8Q68G74 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LHX8Q68G74 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LHX8Q68G74 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LHX8Q68G74 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LHX8Q68G74 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
LHX8Q68G74 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LHX8Q68G74 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LHX8Q68G74 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
LHX8Q68G74 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LHX8Q68G74 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LHX8Q68G74 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LHX8Q68G74 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LHX8Q68G74 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LHX8Q68G74 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LHX8Q68G74 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LHX8Q68G74 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
LHX8Q68G74 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LHX8Q68G74 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
LHX8Q68G74 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LHX8Q68G74 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LHX8Q68G74 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LHX8Q68G74 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LHX8Q68G74 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LHX8Q68G74 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LHX8Q68G74 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LHX8Q68G74 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LHX8Q68G74 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LHX8Q68G74 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms