Protein–RNA interactions for Protein: Q68CZ2

TNS3, Tensin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS3Q68CZ2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
TNS3Q68CZ2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
TNS3Q68CZ2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
TNS3Q68CZ2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
TNS3Q68CZ2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
TNS3Q68CZ2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
TNS3Q68CZ2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
TNS3Q68CZ2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
TNS3Q68CZ2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
TNS3Q68CZ2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
TNS3Q68CZ2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
TNS3Q68CZ2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
TNS3Q68CZ2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
TNS3Q68CZ2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
TNS3Q68CZ2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
TNS3Q68CZ2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
TNS3Q68CZ2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
TNS3Q68CZ2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
TNS3Q68CZ2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
TNS3Q68CZ2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
TNS3Q68CZ2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
TNS3Q68CZ2 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
TNS3Q68CZ2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
TNS3Q68CZ2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
TNS3Q68CZ2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
TNS3Q68CZ2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
TNS3Q68CZ2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
TNS3Q68CZ2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
TNS3Q68CZ2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
TNS3Q68CZ2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
TNS3Q68CZ2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
TNS3Q68CZ2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
TNS3Q68CZ2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
TNS3Q68CZ2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
TNS3Q68CZ2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
TNS3Q68CZ2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
TNS3Q68CZ2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
TNS3Q68CZ2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
TNS3Q68CZ2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
TNS3Q68CZ2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
TNS3Q68CZ2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
TNS3Q68CZ2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
TNS3Q68CZ2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
TNS3Q68CZ2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
TNS3Q68CZ2 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC32.09■■■□□ 2.73
TNS3Q68CZ2 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
TNS3Q68CZ2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
TNS3Q68CZ2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
TNS3Q68CZ2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
TNS3Q68CZ2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
TNS3Q68CZ2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
TNS3Q68CZ2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
TNS3Q68CZ2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
TNS3Q68CZ2 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
TNS3Q68CZ2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
TNS3Q68CZ2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.73
TNS3Q68CZ2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
TNS3Q68CZ2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
TNS3Q68CZ2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
TNS3Q68CZ2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
TNS3Q68CZ2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
TNS3Q68CZ2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
TNS3Q68CZ2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
TNS3Q68CZ2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
TNS3Q68CZ2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
TNS3Q68CZ2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
TNS3Q68CZ2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
TNS3Q68CZ2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
TNS3Q68CZ2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
TNS3Q68CZ2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
TNS3Q68CZ2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
TNS3Q68CZ2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
TNS3Q68CZ2 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
TNS3Q68CZ2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
TNS3Q68CZ2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
TNS3Q68CZ2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
TNS3Q68CZ2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
TNS3Q68CZ2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
TNS3Q68CZ2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
TNS3Q68CZ2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
TNS3Q68CZ2 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
TNS3Q68CZ2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
TNS3Q68CZ2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC32.02■■■□□ 2.72
TNS3Q68CZ2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
TNS3Q68CZ2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
TNS3Q68CZ2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
TNS3Q68CZ2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.72
TNS3Q68CZ2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
TNS3Q68CZ2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
TNS3Q68CZ2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
TNS3Q68CZ2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
TNS3Q68CZ2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
TNS3Q68CZ2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
TNS3Q68CZ2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC32■■■□□ 2.71
TNS3Q68CZ2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
TNS3Q68CZ2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
TNS3Q68CZ2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
TNS3Q68CZ2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
TNS3Q68CZ2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
TNS3Q68CZ2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms