Protein–RNA interactions for Protein: Q643R3

LPCAT4, Lysophospholipid acyltransferase LPCAT4, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPCAT4Q643R3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LPCAT4Q643R3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LPCAT4Q643R3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LPCAT4Q643R3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LPCAT4Q643R3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LPCAT4Q643R3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LPCAT4Q643R3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LPCAT4Q643R3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LPCAT4Q643R3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LPCAT4Q643R3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LPCAT4Q643R3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LPCAT4Q643R3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LPCAT4Q643R3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LPCAT4Q643R3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LPCAT4Q643R3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LPCAT4Q643R3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LPCAT4Q643R3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LPCAT4Q643R3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LPCAT4Q643R3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LPCAT4Q643R3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LPCAT4Q643R3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LPCAT4Q643R3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LPCAT4Q643R3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LPCAT4Q643R3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LPCAT4Q643R3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LPCAT4Q643R3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LPCAT4Q643R3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LPCAT4Q643R3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LPCAT4Q643R3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LPCAT4Q643R3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LPCAT4Q643R3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LPCAT4Q643R3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LPCAT4Q643R3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LPCAT4Q643R3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LPCAT4Q643R3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LPCAT4Q643R3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LPCAT4Q643R3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LPCAT4Q643R3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LPCAT4Q643R3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LPCAT4Q643R3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LPCAT4Q643R3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LPCAT4Q643R3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LPCAT4Q643R3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LPCAT4Q643R3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LPCAT4Q643R3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LPCAT4Q643R3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LPCAT4Q643R3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LPCAT4Q643R3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LPCAT4Q643R3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LPCAT4Q643R3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LPCAT4Q643R3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LPCAT4Q643R3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LPCAT4Q643R3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LPCAT4Q643R3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LPCAT4Q643R3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LPCAT4Q643R3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LPCAT4Q643R3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LPCAT4Q643R3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LPCAT4Q643R3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LPCAT4Q643R3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LPCAT4Q643R3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LPCAT4Q643R3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LPCAT4Q643R3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LPCAT4Q643R3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LPCAT4Q643R3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LPCAT4Q643R3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LPCAT4Q643R3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LPCAT4Q643R3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LPCAT4Q643R3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LPCAT4Q643R3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LPCAT4Q643R3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LPCAT4Q643R3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LPCAT4Q643R3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LPCAT4Q643R3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LPCAT4Q643R3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LPCAT4Q643R3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LPCAT4Q643R3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LPCAT4Q643R3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LPCAT4Q643R3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LPCAT4Q643R3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LPCAT4Q643R3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LPCAT4Q643R3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LPCAT4Q643R3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LPCAT4Q643R3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LPCAT4Q643R3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LPCAT4Q643R3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LPCAT4Q643R3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LPCAT4Q643R3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LPCAT4Q643R3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LPCAT4Q643R3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
LPCAT4Q643R3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LPCAT4Q643R3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LPCAT4Q643R3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LPCAT4Q643R3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LPCAT4Q643R3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LPCAT4Q643R3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LPCAT4Q643R3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LPCAT4Q643R3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LPCAT4Q643R3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LPCAT4Q643R3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms