Protein–RNA interactions for Protein: Q60I27

ALS2CL, ALS2 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CLQ60I27 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ALS2CLQ60I27 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ALS2CLQ60I27 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ALS2CLQ60I27 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ALS2CLQ60I27 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ALS2CLQ60I27 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ALS2CLQ60I27 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ALS2CLQ60I27 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ALS2CLQ60I27 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ALS2CLQ60I27 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ALS2CLQ60I27 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ALS2CLQ60I27 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ALS2CLQ60I27 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ALS2CLQ60I27 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ALS2CLQ60I27 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ALS2CLQ60I27 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ALS2CLQ60I27 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ALS2CLQ60I27 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ALS2CLQ60I27 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ALS2CLQ60I27 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ALS2CLQ60I27 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ALS2CLQ60I27 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ALS2CLQ60I27 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ALS2CLQ60I27 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ALS2CLQ60I27 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ALS2CLQ60I27 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ALS2CLQ60I27 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ALS2CLQ60I27 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ALS2CLQ60I27 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ALS2CLQ60I27 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ALS2CLQ60I27 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ALS2CLQ60I27 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ALS2CLQ60I27 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ALS2CLQ60I27 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ALS2CLQ60I27 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ALS2CLQ60I27 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ALS2CLQ60I27 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ALS2CLQ60I27 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ALS2CLQ60I27 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ALS2CLQ60I27 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ALS2CLQ60I27 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ALS2CLQ60I27 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ALS2CLQ60I27 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ALS2CLQ60I27 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ALS2CLQ60I27 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ALS2CLQ60I27 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ALS2CLQ60I27 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ALS2CLQ60I27 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ALS2CLQ60I27 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ALS2CLQ60I27 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ALS2CLQ60I27 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ALS2CLQ60I27 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ALS2CLQ60I27 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ALS2CLQ60I27 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ALS2CLQ60I27 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ALS2CLQ60I27 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ALS2CLQ60I27 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ALS2CLQ60I27 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ALS2CLQ60I27 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ALS2CLQ60I27 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ALS2CLQ60I27 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ALS2CLQ60I27 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ALS2CLQ60I27 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ALS2CLQ60I27 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ALS2CLQ60I27 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ALS2CLQ60I27 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ALS2CLQ60I27 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ALS2CLQ60I27 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ALS2CLQ60I27 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ALS2CLQ60I27 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ALS2CLQ60I27 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALS2CLQ60I27 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALS2CLQ60I27 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALS2CLQ60I27 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALS2CLQ60I27 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ALS2CLQ60I27 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALS2CLQ60I27 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALS2CLQ60I27 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALS2CLQ60I27 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALS2CLQ60I27 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ALS2CLQ60I27 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ALS2CLQ60I27 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ALS2CLQ60I27 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ALS2CLQ60I27 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ALS2CLQ60I27 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ALS2CLQ60I27 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ALS2CLQ60I27 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ALS2CLQ60I27 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ALS2CLQ60I27 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ALS2CLQ60I27 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ALS2CLQ60I27 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ALS2CLQ60I27 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ALS2CLQ60I27 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ALS2CLQ60I27 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ALS2CLQ60I27 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ALS2CLQ60I27 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ALS2CLQ60I27 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ALS2CLQ60I27 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ALS2CLQ60I27 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ALS2CLQ60I27 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms