Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZK9

CARMIL1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, humanhuman

Predictions only

Length 1,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL1Q5VZK9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
CARMIL1Q5VZK9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
CARMIL1Q5VZK9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.79
CARMIL1Q5VZK9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.79
CARMIL1Q5VZK9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC38.75■■■■□ 3.79
CARMIL1Q5VZK9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
CARMIL1Q5VZK9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC38.74■■■■□ 3.79
CARMIL1Q5VZK9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
CARMIL1Q5VZK9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
CARMIL1Q5VZK9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.73■■■■□ 3.79
CARMIL1Q5VZK9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
CARMIL1Q5VZK9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.72■■■■□ 3.79
CARMIL1Q5VZK9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC38.71■■■■□ 3.79
CARMIL1Q5VZK9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC38.71■■■■□ 3.79
CARMIL1Q5VZK9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC38.71■■■■□ 3.79
CARMIL1Q5VZK9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC38.7■■■■□ 3.79
CARMIL1Q5VZK9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
CARMIL1Q5VZK9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
CARMIL1Q5VZK9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC38.69■■■■□ 3.78
CARMIL1Q5VZK9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC38.69■■■■□ 3.78
CARMIL1Q5VZK9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC38.68■■■■□ 3.78
CARMIL1Q5VZK9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC38.67■■■■□ 3.78
CARMIL1Q5VZK9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
CARMIL1Q5VZK9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC38.67■■■■□ 3.78
CARMIL1Q5VZK9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC38.67■■■■□ 3.78
CARMIL1Q5VZK9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC38.67■■■■□ 3.78
CARMIL1Q5VZK9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
CARMIL1Q5VZK9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
CARMIL1Q5VZK9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
CARMIL1Q5VZK9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
CARMIL1Q5VZK9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
CARMIL1Q5VZK9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
CARMIL1Q5VZK9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC38.65■■■■□ 3.78
CARMIL1Q5VZK9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.65■■■■□ 3.78
CARMIL1Q5VZK9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.64■■■■□ 3.78
CARMIL1Q5VZK9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
CARMIL1Q5VZK9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC38.64■■■■□ 3.78
CARMIL1Q5VZK9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC38.64■■■■□ 3.78
CARMIL1Q5VZK9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
CARMIL1Q5VZK9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
CARMIL1Q5VZK9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC38.63■■■■□ 3.77
CARMIL1Q5VZK9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
CARMIL1Q5VZK9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC38.62■■■■□ 3.77
CARMIL1Q5VZK9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC38.62■■■■□ 3.77
CARMIL1Q5VZK9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
CARMIL1Q5VZK9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
CARMIL1Q5VZK9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.61■■■■□ 3.77
CARMIL1Q5VZK9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC38.61■■■■□ 3.77
CARMIL1Q5VZK9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
CARMIL1Q5VZK9 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC38.6■■■■□ 3.77
CARMIL1Q5VZK9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
CARMIL1Q5VZK9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
CARMIL1Q5VZK9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
CARMIL1Q5VZK9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC38.59■■■■□ 3.77
CARMIL1Q5VZK9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC38.59■■■■□ 3.77
CARMIL1Q5VZK9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
CARMIL1Q5VZK9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
CARMIL1Q5VZK9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
CARMIL1Q5VZK9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
CARMIL1Q5VZK9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC38.58■■■■□ 3.77
CARMIL1Q5VZK9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.58■■■■□ 3.77
CARMIL1Q5VZK9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC38.58■■■■□ 3.77
CARMIL1Q5VZK9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC38.58■■■■□ 3.77
CARMIL1Q5VZK9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
CARMIL1Q5VZK9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
CARMIL1Q5VZK9 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC38.57■■■■□ 3.77
CARMIL1Q5VZK9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC38.57■■■■□ 3.77
CARMIL1Q5VZK9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
CARMIL1Q5VZK9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC38.57■■■■□ 3.76
CARMIL1Q5VZK9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.57■■■■□ 3.76
CARMIL1Q5VZK9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
CARMIL1Q5VZK9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.56■■■■□ 3.76
CARMIL1Q5VZK9 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC38.55■■■■□ 3.76
CARMIL1Q5VZK9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC38.54■■■■□ 3.76
CARMIL1Q5VZK9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
CARMIL1Q5VZK9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
CARMIL1Q5VZK9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.54■■■■□ 3.76
CARMIL1Q5VZK9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
CARMIL1Q5VZK9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC38.54■■■■□ 3.76
CARMIL1Q5VZK9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC38.54■■■■□ 3.76
CARMIL1Q5VZK9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
CARMIL1Q5VZK9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.53■■■■□ 3.76
CARMIL1Q5VZK9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC38.53■■■■□ 3.76
CARMIL1Q5VZK9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
CARMIL1Q5VZK9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
CARMIL1Q5VZK9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
CARMIL1Q5VZK9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC38.52■■■■□ 3.76
CARMIL1Q5VZK9 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC38.52■■■■□ 3.76
CARMIL1Q5VZK9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
CARMIL1Q5VZK9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
CARMIL1Q5VZK9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
CARMIL1Q5VZK9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
CARMIL1Q5VZK9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
CARMIL1Q5VZK9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC38.5■■■■□ 3.75
CARMIL1Q5VZK9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC38.5■■■■□ 3.75
CARMIL1Q5VZK9 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC38.5■■■■□ 3.75
CARMIL1Q5VZK9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC38.5■■■■□ 3.75
CARMIL1Q5VZK9 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC38.5■■■■□ 3.75
CARMIL1Q5VZK9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC38.5■■■■□ 3.75
CARMIL1Q5VZK9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms