Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVQ6

YOD1, Ubiquitin thioesterase OTU1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YOD1Q5VVQ6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
YOD1Q5VVQ6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
YOD1Q5VVQ6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
YOD1Q5VVQ6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
YOD1Q5VVQ6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
YOD1Q5VVQ6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
YOD1Q5VVQ6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
YOD1Q5VVQ6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
YOD1Q5VVQ6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
YOD1Q5VVQ6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
YOD1Q5VVQ6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
YOD1Q5VVQ6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
YOD1Q5VVQ6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
YOD1Q5VVQ6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
YOD1Q5VVQ6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
YOD1Q5VVQ6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
YOD1Q5VVQ6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
YOD1Q5VVQ6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
YOD1Q5VVQ6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
YOD1Q5VVQ6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
YOD1Q5VVQ6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
YOD1Q5VVQ6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
YOD1Q5VVQ6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
YOD1Q5VVQ6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
YOD1Q5VVQ6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
YOD1Q5VVQ6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
YOD1Q5VVQ6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
YOD1Q5VVQ6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
YOD1Q5VVQ6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
YOD1Q5VVQ6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
YOD1Q5VVQ6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
YOD1Q5VVQ6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
YOD1Q5VVQ6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
YOD1Q5VVQ6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
YOD1Q5VVQ6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
YOD1Q5VVQ6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
YOD1Q5VVQ6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
YOD1Q5VVQ6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
YOD1Q5VVQ6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
YOD1Q5VVQ6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
YOD1Q5VVQ6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
YOD1Q5VVQ6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
YOD1Q5VVQ6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
YOD1Q5VVQ6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
YOD1Q5VVQ6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
YOD1Q5VVQ6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
YOD1Q5VVQ6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
YOD1Q5VVQ6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
YOD1Q5VVQ6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
YOD1Q5VVQ6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
YOD1Q5VVQ6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
YOD1Q5VVQ6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
YOD1Q5VVQ6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
YOD1Q5VVQ6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
YOD1Q5VVQ6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
YOD1Q5VVQ6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
YOD1Q5VVQ6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
YOD1Q5VVQ6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
YOD1Q5VVQ6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
YOD1Q5VVQ6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
YOD1Q5VVQ6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
YOD1Q5VVQ6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
YOD1Q5VVQ6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
YOD1Q5VVQ6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
YOD1Q5VVQ6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
YOD1Q5VVQ6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
YOD1Q5VVQ6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
YOD1Q5VVQ6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
YOD1Q5VVQ6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
YOD1Q5VVQ6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
YOD1Q5VVQ6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
YOD1Q5VVQ6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
YOD1Q5VVQ6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
YOD1Q5VVQ6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
YOD1Q5VVQ6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
YOD1Q5VVQ6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
YOD1Q5VVQ6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
YOD1Q5VVQ6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
YOD1Q5VVQ6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
YOD1Q5VVQ6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
YOD1Q5VVQ6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
YOD1Q5VVQ6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
YOD1Q5VVQ6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
YOD1Q5VVQ6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
YOD1Q5VVQ6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
YOD1Q5VVQ6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
YOD1Q5VVQ6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
YOD1Q5VVQ6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
YOD1Q5VVQ6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
YOD1Q5VVQ6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
YOD1Q5VVQ6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
YOD1Q5VVQ6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
YOD1Q5VVQ6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
YOD1Q5VVQ6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
YOD1Q5VVQ6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
YOD1Q5VVQ6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
YOD1Q5VVQ6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
YOD1Q5VVQ6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
YOD1Q5VVQ6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
YOD1Q5VVQ6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms