Protein–RNA interactions for Protein: Q5VV63

ATRNL1, Attractin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRNL1Q5VV63 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ATRNL1Q5VV63 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ATRNL1Q5VV63 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ATRNL1Q5VV63 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ATRNL1Q5VV63 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATRNL1Q5VV63 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATRNL1Q5VV63 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATRNL1Q5VV63 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATRNL1Q5VV63 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATRNL1Q5VV63 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATRNL1Q5VV63 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATRNL1Q5VV63 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATRNL1Q5VV63 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
ATRNL1Q5VV63 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATRNL1Q5VV63 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATRNL1Q5VV63 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
ATRNL1Q5VV63 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATRNL1Q5VV63 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATRNL1Q5VV63 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATRNL1Q5VV63 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATRNL1Q5VV63 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATRNL1Q5VV63 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATRNL1Q5VV63 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
ATRNL1Q5VV63 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
ATRNL1Q5VV63 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATRNL1Q5VV63 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATRNL1Q5VV63 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATRNL1Q5VV63 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATRNL1Q5VV63 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATRNL1Q5VV63 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATRNL1Q5VV63 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATRNL1Q5VV63 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
ATRNL1Q5VV63 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATRNL1Q5VV63 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
ATRNL1Q5VV63 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATRNL1Q5VV63 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
ATRNL1Q5VV63 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATRNL1Q5VV63 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATRNL1Q5VV63 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATRNL1Q5VV63 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATRNL1Q5VV63 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATRNL1Q5VV63 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATRNL1Q5VV63 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATRNL1Q5VV63 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATRNL1Q5VV63 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATRNL1Q5VV63 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATRNL1Q5VV63 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATRNL1Q5VV63 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATRNL1Q5VV63 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
ATRNL1Q5VV63 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
ATRNL1Q5VV63 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATRNL1Q5VV63 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATRNL1Q5VV63 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATRNL1Q5VV63 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATRNL1Q5VV63 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATRNL1Q5VV63 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATRNL1Q5VV63 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATRNL1Q5VV63 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATRNL1Q5VV63 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATRNL1Q5VV63 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATRNL1Q5VV63 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATRNL1Q5VV63 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATRNL1Q5VV63 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATRNL1Q5VV63 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATRNL1Q5VV63 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATRNL1Q5VV63 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATRNL1Q5VV63 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATRNL1Q5VV63 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
ATRNL1Q5VV63 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATRNL1Q5VV63 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATRNL1Q5VV63 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATRNL1Q5VV63 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATRNL1Q5VV63 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATRNL1Q5VV63 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATRNL1Q5VV63 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATRNL1Q5VV63 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATRNL1Q5VV63 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATRNL1Q5VV63 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATRNL1Q5VV63 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATRNL1Q5VV63 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATRNL1Q5VV63 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATRNL1Q5VV63 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATRNL1Q5VV63 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
ATRNL1Q5VV63 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATRNL1Q5VV63 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATRNL1Q5VV63 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATRNL1Q5VV63 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATRNL1Q5VV63 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATRNL1Q5VV63 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATRNL1Q5VV63 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATRNL1Q5VV63 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATRNL1Q5VV63 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATRNL1Q5VV63 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATRNL1Q5VV63 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATRNL1Q5VV63 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATRNL1Q5VV63 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATRNL1Q5VV63 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
ATRNL1Q5VV63 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATRNL1Q5VV63 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATRNL1Q5VV63 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms