Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT98

PRAMEF20, PRAME family member 20, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF20Q5VT98 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRAMEF20Q5VT98 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRAMEF20Q5VT98 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRAMEF20Q5VT98 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRAMEF20Q5VT98 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRAMEF20Q5VT98 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRAMEF20Q5VT98 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRAMEF20Q5VT98 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRAMEF20Q5VT98 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRAMEF20Q5VT98 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRAMEF20Q5VT98 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PRAMEF20Q5VT98 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRAMEF20Q5VT98 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRAMEF20Q5VT98 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRAMEF20Q5VT98 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRAMEF20Q5VT98 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRAMEF20Q5VT98 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRAMEF20Q5VT98 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRAMEF20Q5VT98 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRAMEF20Q5VT98 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRAMEF20Q5VT98 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PRAMEF20Q5VT98 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PRAMEF20Q5VT98 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PRAMEF20Q5VT98 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRAMEF20Q5VT98 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRAMEF20Q5VT98 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRAMEF20Q5VT98 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRAMEF20Q5VT98 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRAMEF20Q5VT98 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PRAMEF20Q5VT98 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRAMEF20Q5VT98 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEF20Q5VT98 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEF20Q5VT98 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEF20Q5VT98 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEF20Q5VT98 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEF20Q5VT98 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEF20Q5VT98 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEF20Q5VT98 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEF20Q5VT98 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEF20Q5VT98 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEF20Q5VT98 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEF20Q5VT98 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEF20Q5VT98 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEF20Q5VT98 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEF20Q5VT98 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEF20Q5VT98 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEF20Q5VT98 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEF20Q5VT98 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEF20Q5VT98 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEF20Q5VT98 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEF20Q5VT98 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEF20Q5VT98 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEF20Q5VT98 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEF20Q5VT98 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEF20Q5VT98 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEF20Q5VT98 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEF20Q5VT98 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEF20Q5VT98 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEF20Q5VT98 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEF20Q5VT98 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEF20Q5VT98 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEF20Q5VT98 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEF20Q5VT98 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEF20Q5VT98 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEF20Q5VT98 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEF20Q5VT98 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEF20Q5VT98 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEF20Q5VT98 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEF20Q5VT98 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEF20Q5VT98 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAMEF20Q5VT98 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAMEF20Q5VT98 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAMEF20Q5VT98 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAMEF20Q5VT98 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAMEF20Q5VT98 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAMEF20Q5VT98 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAMEF20Q5VT98 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAMEF20Q5VT98 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAMEF20Q5VT98 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAMEF20Q5VT98 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEF20Q5VT98 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEF20Q5VT98 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEF20Q5VT98 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEF20Q5VT98 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF20Q5VT98 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF20Q5VT98 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF20Q5VT98 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF20Q5VT98 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF20Q5VT98 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF20Q5VT98 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF20Q5VT98 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF20Q5VT98 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF20Q5VT98 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEF20Q5VT98 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEF20Q5VT98 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEF20Q5VT98 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEF20Q5VT98 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEF20Q5VT98 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEF20Q5VT98 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEF20Q5VT98 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.2 ms