Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
STRIP1Q5VSL9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
STRIP1Q5VSL9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
STRIP1Q5VSL9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
STRIP1Q5VSL9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
STRIP1Q5VSL9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
STRIP1Q5VSL9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
STRIP1Q5VSL9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
STRIP1Q5VSL9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
STRIP1Q5VSL9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
STRIP1Q5VSL9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
STRIP1Q5VSL9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
STRIP1Q5VSL9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
STRIP1Q5VSL9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
STRIP1Q5VSL9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
STRIP1Q5VSL9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
STRIP1Q5VSL9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
STRIP1Q5VSL9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
STRIP1Q5VSL9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
STRIP1Q5VSL9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
STRIP1Q5VSL9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
STRIP1Q5VSL9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
STRIP1Q5VSL9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
STRIP1Q5VSL9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
STRIP1Q5VSL9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
STRIP1Q5VSL9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
STRIP1Q5VSL9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
STRIP1Q5VSL9 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
STRIP1Q5VSL9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
STRIP1Q5VSL9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
STRIP1Q5VSL9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
STRIP1Q5VSL9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
STRIP1Q5VSL9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
STRIP1Q5VSL9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
STRIP1Q5VSL9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
STRIP1Q5VSL9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
STRIP1Q5VSL9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
STRIP1Q5VSL9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
STRIP1Q5VSL9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
STRIP1Q5VSL9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
STRIP1Q5VSL9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
STRIP1Q5VSL9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
STRIP1Q5VSL9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
STRIP1Q5VSL9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
STRIP1Q5VSL9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
STRIP1Q5VSL9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
STRIP1Q5VSL9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
STRIP1Q5VSL9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
STRIP1Q5VSL9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
STRIP1Q5VSL9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
STRIP1Q5VSL9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
STRIP1Q5VSL9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
STRIP1Q5VSL9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
STRIP1Q5VSL9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
STRIP1Q5VSL9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
STRIP1Q5VSL9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
STRIP1Q5VSL9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
STRIP1Q5VSL9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
STRIP1Q5VSL9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
STRIP1Q5VSL9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
STRIP1Q5VSL9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
STRIP1Q5VSL9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
STRIP1Q5VSL9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
STRIP1Q5VSL9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
STRIP1Q5VSL9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
STRIP1Q5VSL9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
STRIP1Q5VSL9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
STRIP1Q5VSL9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
STRIP1Q5VSL9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
STRIP1Q5VSL9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
STRIP1Q5VSL9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
STRIP1Q5VSL9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
STRIP1Q5VSL9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
STRIP1Q5VSL9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
STRIP1Q5VSL9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
STRIP1Q5VSL9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
STRIP1Q5VSL9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
STRIP1Q5VSL9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
STRIP1Q5VSL9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
STRIP1Q5VSL9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
STRIP1Q5VSL9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
STRIP1Q5VSL9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
STRIP1Q5VSL9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
STRIP1Q5VSL9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
STRIP1Q5VSL9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
STRIP1Q5VSL9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
STRIP1Q5VSL9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
STRIP1Q5VSL9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
STRIP1Q5VSL9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
STRIP1Q5VSL9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
STRIP1Q5VSL9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
STRIP1Q5VSL9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
STRIP1Q5VSL9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
STRIP1Q5VSL9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
STRIP1Q5VSL9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
STRIP1Q5VSL9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
STRIP1Q5VSL9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
STRIP1Q5VSL9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
STRIP1Q5VSL9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
STRIP1Q5VSL9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms