Protein–RNA interactions for Protein: Q5TKA1

LIN9, Protein lin-9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN9Q5TKA1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LIN9Q5TKA1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LIN9Q5TKA1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LIN9Q5TKA1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LIN9Q5TKA1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
LIN9Q5TKA1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LIN9Q5TKA1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LIN9Q5TKA1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LIN9Q5TKA1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LIN9Q5TKA1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LIN9Q5TKA1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LIN9Q5TKA1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LIN9Q5TKA1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LIN9Q5TKA1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LIN9Q5TKA1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LIN9Q5TKA1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LIN9Q5TKA1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
LIN9Q5TKA1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LIN9Q5TKA1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LIN9Q5TKA1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LIN9Q5TKA1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LIN9Q5TKA1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LIN9Q5TKA1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LIN9Q5TKA1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LIN9Q5TKA1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LIN9Q5TKA1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LIN9Q5TKA1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LIN9Q5TKA1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LIN9Q5TKA1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LIN9Q5TKA1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LIN9Q5TKA1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LIN9Q5TKA1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LIN9Q5TKA1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LIN9Q5TKA1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LIN9Q5TKA1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LIN9Q5TKA1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LIN9Q5TKA1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LIN9Q5TKA1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LIN9Q5TKA1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LIN9Q5TKA1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LIN9Q5TKA1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
LIN9Q5TKA1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LIN9Q5TKA1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LIN9Q5TKA1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LIN9Q5TKA1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LIN9Q5TKA1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LIN9Q5TKA1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
LIN9Q5TKA1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LIN9Q5TKA1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LIN9Q5TKA1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LIN9Q5TKA1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LIN9Q5TKA1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LIN9Q5TKA1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LIN9Q5TKA1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LIN9Q5TKA1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LIN9Q5TKA1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LIN9Q5TKA1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LIN9Q5TKA1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LIN9Q5TKA1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LIN9Q5TKA1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
LIN9Q5TKA1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LIN9Q5TKA1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LIN9Q5TKA1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
LIN9Q5TKA1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LIN9Q5TKA1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LIN9Q5TKA1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LIN9Q5TKA1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LIN9Q5TKA1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LIN9Q5TKA1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LIN9Q5TKA1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
LIN9Q5TKA1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LIN9Q5TKA1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LIN9Q5TKA1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LIN9Q5TKA1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LIN9Q5TKA1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LIN9Q5TKA1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LIN9Q5TKA1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LIN9Q5TKA1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LIN9Q5TKA1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LIN9Q5TKA1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LIN9Q5TKA1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LIN9Q5TKA1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LIN9Q5TKA1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LIN9Q5TKA1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LIN9Q5TKA1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LIN9Q5TKA1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LIN9Q5TKA1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LIN9Q5TKA1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LIN9Q5TKA1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LIN9Q5TKA1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LIN9Q5TKA1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LIN9Q5TKA1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LIN9Q5TKA1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LIN9Q5TKA1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LIN9Q5TKA1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LIN9Q5TKA1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
LIN9Q5TKA1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
LIN9Q5TKA1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LIN9Q5TKA1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LIN9Q5TKA1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.7 ms