Protein–RNA interactions for Protein: Q5TC63

GRTP1, Growth hormone-regulated TBC protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRTP1Q5TC63 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRTP1Q5TC63 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRTP1Q5TC63 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRTP1Q5TC63 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRTP1Q5TC63 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GRTP1Q5TC63 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRTP1Q5TC63 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRTP1Q5TC63 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRTP1Q5TC63 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRTP1Q5TC63 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRTP1Q5TC63 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRTP1Q5TC63 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRTP1Q5TC63 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRTP1Q5TC63 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRTP1Q5TC63 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRTP1Q5TC63 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRTP1Q5TC63 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRTP1Q5TC63 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRTP1Q5TC63 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRTP1Q5TC63 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRTP1Q5TC63 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
GRTP1Q5TC63 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
GRTP1Q5TC63 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GRTP1Q5TC63 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRTP1Q5TC63 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRTP1Q5TC63 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRTP1Q5TC63 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRTP1Q5TC63 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRTP1Q5TC63 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRTP1Q5TC63 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GRTP1Q5TC63 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRTP1Q5TC63 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRTP1Q5TC63 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRTP1Q5TC63 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GRTP1Q5TC63 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRTP1Q5TC63 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRTP1Q5TC63 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRTP1Q5TC63 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRTP1Q5TC63 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRTP1Q5TC63 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRTP1Q5TC63 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRTP1Q5TC63 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GRTP1Q5TC63 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRTP1Q5TC63 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRTP1Q5TC63 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRTP1Q5TC63 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRTP1Q5TC63 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRTP1Q5TC63 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRTP1Q5TC63 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRTP1Q5TC63 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRTP1Q5TC63 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRTP1Q5TC63 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRTP1Q5TC63 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRTP1Q5TC63 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRTP1Q5TC63 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRTP1Q5TC63 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRTP1Q5TC63 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRTP1Q5TC63 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRTP1Q5TC63 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRTP1Q5TC63 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRTP1Q5TC63 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRTP1Q5TC63 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRTP1Q5TC63 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRTP1Q5TC63 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRTP1Q5TC63 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRTP1Q5TC63 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRTP1Q5TC63 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRTP1Q5TC63 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRTP1Q5TC63 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRTP1Q5TC63 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRTP1Q5TC63 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRTP1Q5TC63 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRTP1Q5TC63 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRTP1Q5TC63 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRTP1Q5TC63 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRTP1Q5TC63 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRTP1Q5TC63 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GRTP1Q5TC63 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GRTP1Q5TC63 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GRTP1Q5TC63 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GRTP1Q5TC63 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRTP1Q5TC63 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRTP1Q5TC63 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRTP1Q5TC63 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRTP1Q5TC63 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRTP1Q5TC63 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRTP1Q5TC63 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRTP1Q5TC63 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRTP1Q5TC63 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRTP1Q5TC63 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRTP1Q5TC63 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRTP1Q5TC63 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRTP1Q5TC63 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRTP1Q5TC63 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRTP1Q5TC63 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRTP1Q5TC63 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRTP1Q5TC63 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRTP1Q5TC63 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRTP1Q5TC63 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRTP1Q5TC63 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms