Protein–RNA interactions for Protein: Q5T9S5

CCDC18, Coiled-coil domain-containing protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 1,454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC18Q5T9S5 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC36.88■■■■□ 3.49
CCDC18Q5T9S5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
CCDC18Q5T9S5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
CCDC18Q5T9S5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
CCDC18Q5T9S5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
CCDC18Q5T9S5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
CCDC18Q5T9S5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
CCDC18Q5T9S5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC36.86■■■■□ 3.49
CCDC18Q5T9S5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC36.86■■■■□ 3.49
CCDC18Q5T9S5 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
CCDC18Q5T9S5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC36.86■■■■□ 3.49
CCDC18Q5T9S5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
CCDC18Q5T9S5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
CCDC18Q5T9S5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
CCDC18Q5T9S5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
CCDC18Q5T9S5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
CCDC18Q5T9S5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC36.85■■■■□ 3.49
CCDC18Q5T9S5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
CCDC18Q5T9S5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
CCDC18Q5T9S5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
CCDC18Q5T9S5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
CCDC18Q5T9S5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
CCDC18Q5T9S5 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
CCDC18Q5T9S5 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC36.83■■■■□ 3.49
CCDC18Q5T9S5 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
CCDC18Q5T9S5 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC36.83■■■■□ 3.49
CCDC18Q5T9S5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
CCDC18Q5T9S5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
CCDC18Q5T9S5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
CCDC18Q5T9S5 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
CCDC18Q5T9S5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
CCDC18Q5T9S5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
CCDC18Q5T9S5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
CCDC18Q5T9S5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
CCDC18Q5T9S5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
CCDC18Q5T9S5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
CCDC18Q5T9S5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
CCDC18Q5T9S5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
CCDC18Q5T9S5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
CCDC18Q5T9S5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
CCDC18Q5T9S5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
CCDC18Q5T9S5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC36.79■■■■□ 3.48
CCDC18Q5T9S5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
CCDC18Q5T9S5 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
CCDC18Q5T9S5 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
CCDC18Q5T9S5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
CCDC18Q5T9S5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
CCDC18Q5T9S5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
CCDC18Q5T9S5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
CCDC18Q5T9S5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC36.77■■■■□ 3.48
CCDC18Q5T9S5 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
CCDC18Q5T9S5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
CCDC18Q5T9S5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC36.76■■■■□ 3.48
CCDC18Q5T9S5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC36.76■■■■□ 3.48
CCDC18Q5T9S5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
CCDC18Q5T9S5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
CCDC18Q5T9S5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.47
CCDC18Q5T9S5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
CCDC18Q5T9S5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
CCDC18Q5T9S5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
CCDC18Q5T9S5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
CCDC18Q5T9S5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
CCDC18Q5T9S5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
CCDC18Q5T9S5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
CCDC18Q5T9S5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
CCDC18Q5T9S5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
CCDC18Q5T9S5 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
CCDC18Q5T9S5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
CCDC18Q5T9S5 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
CCDC18Q5T9S5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
CCDC18Q5T9S5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC36.72■■■■□ 3.47
CCDC18Q5T9S5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC36.71■■■■□ 3.47
CCDC18Q5T9S5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
CCDC18Q5T9S5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
CCDC18Q5T9S5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
CCDC18Q5T9S5 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
CCDC18Q5T9S5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
CCDC18Q5T9S5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
CCDC18Q5T9S5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
CCDC18Q5T9S5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
CCDC18Q5T9S5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
CCDC18Q5T9S5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
CCDC18Q5T9S5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
CCDC18Q5T9S5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
CCDC18Q5T9S5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
CCDC18Q5T9S5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
CCDC18Q5T9S5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
CCDC18Q5T9S5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
CCDC18Q5T9S5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
CCDC18Q5T9S5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
CCDC18Q5T9S5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
CCDC18Q5T9S5 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
CCDC18Q5T9S5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
CCDC18Q5T9S5 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
CCDC18Q5T9S5 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
CCDC18Q5T9S5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
CCDC18Q5T9S5 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
CCDC18Q5T9S5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
CCDC18Q5T9S5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
CCDC18Q5T9S5 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC36.66■■■■□ 3.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms