Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7N2

L1TD1, LINE-1 type transposase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 865 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1TD1Q5T7N2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
L1TD1Q5T7N2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
L1TD1Q5T7N2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
L1TD1Q5T7N2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
L1TD1Q5T7N2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
L1TD1Q5T7N2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
L1TD1Q5T7N2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
L1TD1Q5T7N2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
L1TD1Q5T7N2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
L1TD1Q5T7N2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
L1TD1Q5T7N2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
L1TD1Q5T7N2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
L1TD1Q5T7N2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
L1TD1Q5T7N2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
L1TD1Q5T7N2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
L1TD1Q5T7N2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
L1TD1Q5T7N2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
L1TD1Q5T7N2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
L1TD1Q5T7N2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
L1TD1Q5T7N2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
L1TD1Q5T7N2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
L1TD1Q5T7N2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
L1TD1Q5T7N2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
L1TD1Q5T7N2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
L1TD1Q5T7N2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
L1TD1Q5T7N2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
L1TD1Q5T7N2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
L1TD1Q5T7N2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
L1TD1Q5T7N2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
L1TD1Q5T7N2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
L1TD1Q5T7N2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
L1TD1Q5T7N2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
L1TD1Q5T7N2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
L1TD1Q5T7N2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
L1TD1Q5T7N2 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
L1TD1Q5T7N2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
L1TD1Q5T7N2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
L1TD1Q5T7N2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
L1TD1Q5T7N2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
L1TD1Q5T7N2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
L1TD1Q5T7N2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
L1TD1Q5T7N2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
L1TD1Q5T7N2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
L1TD1Q5T7N2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
L1TD1Q5T7N2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
L1TD1Q5T7N2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
L1TD1Q5T7N2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
L1TD1Q5T7N2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
L1TD1Q5T7N2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
L1TD1Q5T7N2 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
L1TD1Q5T7N2 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
L1TD1Q5T7N2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
L1TD1Q5T7N2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
L1TD1Q5T7N2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
L1TD1Q5T7N2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
L1TD1Q5T7N2 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
L1TD1Q5T7N2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
L1TD1Q5T7N2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
L1TD1Q5T7N2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
L1TD1Q5T7N2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
L1TD1Q5T7N2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
L1TD1Q5T7N2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
L1TD1Q5T7N2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
L1TD1Q5T7N2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
L1TD1Q5T7N2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
L1TD1Q5T7N2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
L1TD1Q5T7N2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
L1TD1Q5T7N2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
L1TD1Q5T7N2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
L1TD1Q5T7N2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
L1TD1Q5T7N2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
L1TD1Q5T7N2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
L1TD1Q5T7N2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
L1TD1Q5T7N2 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
L1TD1Q5T7N2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
L1TD1Q5T7N2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
L1TD1Q5T7N2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
L1TD1Q5T7N2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
L1TD1Q5T7N2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
L1TD1Q5T7N2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
L1TD1Q5T7N2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
L1TD1Q5T7N2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
L1TD1Q5T7N2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
L1TD1Q5T7N2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
L1TD1Q5T7N2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
L1TD1Q5T7N2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
L1TD1Q5T7N2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
L1TD1Q5T7N2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
L1TD1Q5T7N2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
L1TD1Q5T7N2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
L1TD1Q5T7N2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
L1TD1Q5T7N2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
L1TD1Q5T7N2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
L1TD1Q5T7N2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
L1TD1Q5T7N2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
L1TD1Q5T7N2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
L1TD1Q5T7N2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
L1TD1Q5T7N2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
L1TD1Q5T7N2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
L1TD1Q5T7N2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms