Protein–RNA interactions for Protein: Q5T700

LDLRAD1, Low-density lipoprotein receptor class A domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAD1Q5T700 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LDLRAD1Q5T700 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LDLRAD1Q5T700 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LDLRAD1Q5T700 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LDLRAD1Q5T700 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LDLRAD1Q5T700 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LDLRAD1Q5T700 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
LDLRAD1Q5T700 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
LDLRAD1Q5T700 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LDLRAD1Q5T700 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LDLRAD1Q5T700 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
LDLRAD1Q5T700 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LDLRAD1Q5T700 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LDLRAD1Q5T700 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LDLRAD1Q5T700 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LDLRAD1Q5T700 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LDLRAD1Q5T700 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LDLRAD1Q5T700 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LDLRAD1Q5T700 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LDLRAD1Q5T700 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LDLRAD1Q5T700 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LDLRAD1Q5T700 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
LDLRAD1Q5T700 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
LDLRAD1Q5T700 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LDLRAD1Q5T700 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LDLRAD1Q5T700 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LDLRAD1Q5T700 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LDLRAD1Q5T700 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LDLRAD1Q5T700 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LDLRAD1Q5T700 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
LDLRAD1Q5T700 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LDLRAD1Q5T700 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LDLRAD1Q5T700 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LDLRAD1Q5T700 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LDLRAD1Q5T700 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LDLRAD1Q5T700 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LDLRAD1Q5T700 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LDLRAD1Q5T700 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LDLRAD1Q5T700 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LDLRAD1Q5T700 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LDLRAD1Q5T700 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LDLRAD1Q5T700 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LDLRAD1Q5T700 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LDLRAD1Q5T700 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LDLRAD1Q5T700 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LDLRAD1Q5T700 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LDLRAD1Q5T700 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LDLRAD1Q5T700 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LDLRAD1Q5T700 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LDLRAD1Q5T700 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LDLRAD1Q5T700 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LDLRAD1Q5T700 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LDLRAD1Q5T700 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LDLRAD1Q5T700 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LDLRAD1Q5T700 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
LDLRAD1Q5T700 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LDLRAD1Q5T700 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LDLRAD1Q5T700 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LDLRAD1Q5T700 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LDLRAD1Q5T700 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LDLRAD1Q5T700 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
LDLRAD1Q5T700 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
LDLRAD1Q5T700 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LDLRAD1Q5T700 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LDLRAD1Q5T700 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LDLRAD1Q5T700 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LDLRAD1Q5T700 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LDLRAD1Q5T700 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LDLRAD1Q5T700 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
LDLRAD1Q5T700 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LDLRAD1Q5T700 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LDLRAD1Q5T700 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LDLRAD1Q5T700 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
LDLRAD1Q5T700 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
LDLRAD1Q5T700 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LDLRAD1Q5T700 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LDLRAD1Q5T700 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LDLRAD1Q5T700 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LDLRAD1Q5T700 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
LDLRAD1Q5T700 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LDLRAD1Q5T700 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
LDLRAD1Q5T700 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
LDLRAD1Q5T700 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.57■■■□□ 2
LDLRAD1Q5T700 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LDLRAD1Q5T700 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
LDLRAD1Q5T700 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
LDLRAD1Q5T700 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
LDLRAD1Q5T700 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC27.56■■■□□ 2
LDLRAD1Q5T700 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
LDLRAD1Q5T700 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC27.56■■■□□ 2
LDLRAD1Q5T700 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LDLRAD1Q5T700 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LDLRAD1Q5T700 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LDLRAD1Q5T700 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
LDLRAD1Q5T700 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LDLRAD1Q5T700 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
LDLRAD1Q5T700 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
LDLRAD1Q5T700 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LDLRAD1Q5T700 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LDLRAD1Q5T700 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms