Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6F2

UBAP2, Ubiquitin-associated protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAP2Q5T6F2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBAP2Q5T6F2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
UBAP2Q5T6F2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
UBAP2Q5T6F2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBAP2Q5T6F2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBAP2Q5T6F2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
UBAP2Q5T6F2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBAP2Q5T6F2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBAP2Q5T6F2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBAP2Q5T6F2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBAP2Q5T6F2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBAP2Q5T6F2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBAP2Q5T6F2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBAP2Q5T6F2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBAP2Q5T6F2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBAP2Q5T6F2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBAP2Q5T6F2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBAP2Q5T6F2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBAP2Q5T6F2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBAP2Q5T6F2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBAP2Q5T6F2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBAP2Q5T6F2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
UBAP2Q5T6F2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBAP2Q5T6F2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBAP2Q5T6F2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBAP2Q5T6F2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBAP2Q5T6F2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBAP2Q5T6F2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBAP2Q5T6F2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBAP2Q5T6F2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBAP2Q5T6F2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBAP2Q5T6F2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBAP2Q5T6F2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBAP2Q5T6F2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
UBAP2Q5T6F2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBAP2Q5T6F2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBAP2Q5T6F2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBAP2Q5T6F2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
UBAP2Q5T6F2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBAP2Q5T6F2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBAP2Q5T6F2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBAP2Q5T6F2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBAP2Q5T6F2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBAP2Q5T6F2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBAP2Q5T6F2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBAP2Q5T6F2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBAP2Q5T6F2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBAP2Q5T6F2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBAP2Q5T6F2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBAP2Q5T6F2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
UBAP2Q5T6F2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
UBAP2Q5T6F2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBAP2Q5T6F2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
UBAP2Q5T6F2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
UBAP2Q5T6F2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
UBAP2Q5T6F2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
UBAP2Q5T6F2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBAP2Q5T6F2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBAP2Q5T6F2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBAP2Q5T6F2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBAP2Q5T6F2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBAP2Q5T6F2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBAP2Q5T6F2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBAP2Q5T6F2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBAP2Q5T6F2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBAP2Q5T6F2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBAP2Q5T6F2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBAP2Q5T6F2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBAP2Q5T6F2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBAP2Q5T6F2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBAP2Q5T6F2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBAP2Q5T6F2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBAP2Q5T6F2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBAP2Q5T6F2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBAP2Q5T6F2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBAP2Q5T6F2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
UBAP2Q5T6F2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBAP2Q5T6F2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBAP2Q5T6F2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBAP2Q5T6F2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBAP2Q5T6F2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBAP2Q5T6F2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBAP2Q5T6F2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBAP2Q5T6F2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBAP2Q5T6F2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBAP2Q5T6F2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBAP2Q5T6F2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBAP2Q5T6F2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBAP2Q5T6F2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBAP2Q5T6F2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
UBAP2Q5T6F2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBAP2Q5T6F2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBAP2Q5T6F2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBAP2Q5T6F2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBAP2Q5T6F2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBAP2Q5T6F2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBAP2Q5T6F2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBAP2Q5T6F2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBAP2Q5T6F2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBAP2Q5T6F2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms