Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5M9

CCNJ, Cyclin-J, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNJQ5T5M9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCNJQ5T5M9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCNJQ5T5M9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCNJQ5T5M9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCNJQ5T5M9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCNJQ5T5M9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCNJQ5T5M9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCNJQ5T5M9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCNJQ5T5M9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCNJQ5T5M9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCNJQ5T5M9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCNJQ5T5M9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCNJQ5T5M9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCNJQ5T5M9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CCNJQ5T5M9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCNJQ5T5M9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCNJQ5T5M9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCNJQ5T5M9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCNJQ5T5M9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CCNJQ5T5M9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCNJQ5T5M9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCNJQ5T5M9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCNJQ5T5M9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCNJQ5T5M9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCNJQ5T5M9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCNJQ5T5M9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCNJQ5T5M9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCNJQ5T5M9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCNJQ5T5M9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCNJQ5T5M9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCNJQ5T5M9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCNJQ5T5M9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCNJQ5T5M9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCNJQ5T5M9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCNJQ5T5M9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCNJQ5T5M9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCNJQ5T5M9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCNJQ5T5M9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCNJQ5T5M9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCNJQ5T5M9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCNJQ5T5M9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCNJQ5T5M9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCNJQ5T5M9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCNJQ5T5M9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
CCNJQ5T5M9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCNJQ5T5M9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCNJQ5T5M9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCNJQ5T5M9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCNJQ5T5M9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CCNJQ5T5M9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCNJQ5T5M9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCNJQ5T5M9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCNJQ5T5M9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCNJQ5T5M9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCNJQ5T5M9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCNJQ5T5M9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCNJQ5T5M9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCNJQ5T5M9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCNJQ5T5M9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCNJQ5T5M9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCNJQ5T5M9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCNJQ5T5M9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCNJQ5T5M9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCNJQ5T5M9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCNJQ5T5M9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCNJQ5T5M9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CCNJQ5T5M9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCNJQ5T5M9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCNJQ5T5M9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CCNJQ5T5M9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCNJQ5T5M9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCNJQ5T5M9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCNJQ5T5M9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCNJQ5T5M9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCNJQ5T5M9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCNJQ5T5M9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCNJQ5T5M9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CCNJQ5T5M9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCNJQ5T5M9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCNJQ5T5M9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCNJQ5T5M9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCNJQ5T5M9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCNJQ5T5M9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCNJQ5T5M9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCNJQ5T5M9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCNJQ5T5M9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCNJQ5T5M9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCNJQ5T5M9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCNJQ5T5M9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCNJQ5T5M9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCNJQ5T5M9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCNJQ5T5M9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCNJQ5T5M9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCNJQ5T5M9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCNJQ5T5M9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCNJQ5T5M9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCNJQ5T5M9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCNJQ5T5M9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCNJQ5T5M9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCNJQ5T5M9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
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