Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZQ8

CELF3, CUGBP Elav-like family member 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF3Q5SZQ8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CELF3Q5SZQ8 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CELF3Q5SZQ8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CELF3Q5SZQ8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CELF3Q5SZQ8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CELF3Q5SZQ8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CELF3Q5SZQ8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CELF3Q5SZQ8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CELF3Q5SZQ8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CELF3Q5SZQ8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CELF3Q5SZQ8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CELF3Q5SZQ8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CELF3Q5SZQ8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CELF3Q5SZQ8 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CELF3Q5SZQ8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CELF3Q5SZQ8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CELF3Q5SZQ8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CELF3Q5SZQ8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CELF3Q5SZQ8 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CELF3Q5SZQ8 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CELF3Q5SZQ8 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CELF3Q5SZQ8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CELF3Q5SZQ8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CELF3Q5SZQ8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CELF3Q5SZQ8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CELF3Q5SZQ8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CELF3Q5SZQ8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
CELF3Q5SZQ8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CELF3Q5SZQ8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CELF3Q5SZQ8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CELF3Q5SZQ8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CELF3Q5SZQ8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CELF3Q5SZQ8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CELF3Q5SZQ8 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CELF3Q5SZQ8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CELF3Q5SZQ8 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CELF3Q5SZQ8 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CELF3Q5SZQ8 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CELF3Q5SZQ8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CELF3Q5SZQ8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CELF3Q5SZQ8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CELF3Q5SZQ8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CELF3Q5SZQ8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CELF3Q5SZQ8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CELF3Q5SZQ8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CELF3Q5SZQ8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CELF3Q5SZQ8 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CELF3Q5SZQ8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CELF3Q5SZQ8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CELF3Q5SZQ8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CELF3Q5SZQ8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CELF3Q5SZQ8 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CELF3Q5SZQ8 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CELF3Q5SZQ8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CELF3Q5SZQ8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CELF3Q5SZQ8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CELF3Q5SZQ8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CELF3Q5SZQ8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CELF3Q5SZQ8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CELF3Q5SZQ8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CELF3Q5SZQ8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CELF3Q5SZQ8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CELF3Q5SZQ8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CELF3Q5SZQ8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CELF3Q5SZQ8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CELF3Q5SZQ8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CELF3Q5SZQ8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CELF3Q5SZQ8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CELF3Q5SZQ8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CELF3Q5SZQ8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CELF3Q5SZQ8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CELF3Q5SZQ8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CELF3Q5SZQ8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CELF3Q5SZQ8 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CELF3Q5SZQ8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CELF3Q5SZQ8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CELF3Q5SZQ8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CELF3Q5SZQ8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CELF3Q5SZQ8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CELF3Q5SZQ8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CELF3Q5SZQ8 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CELF3Q5SZQ8 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CELF3Q5SZQ8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CELF3Q5SZQ8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CELF3Q5SZQ8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CELF3Q5SZQ8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CELF3Q5SZQ8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CELF3Q5SZQ8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CELF3Q5SZQ8 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CELF3Q5SZQ8 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CELF3Q5SZQ8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CELF3Q5SZQ8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CELF3Q5SZQ8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CELF3Q5SZQ8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CELF3Q5SZQ8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CELF3Q5SZQ8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CELF3Q5SZQ8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CELF3Q5SZQ8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CELF3Q5SZQ8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CELF3Q5SZQ8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
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