Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV17

TMEM240, Transmembrane protein 240, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM240Q5SV17 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM240Q5SV17 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM240Q5SV17 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM240Q5SV17 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM240Q5SV17 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM240Q5SV17 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM240Q5SV17 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM240Q5SV17 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM240Q5SV17 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM240Q5SV17 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM240Q5SV17 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM240Q5SV17 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMEM240Q5SV17 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMEM240Q5SV17 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMEM240Q5SV17 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMEM240Q5SV17 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMEM240Q5SV17 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMEM240Q5SV17 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMEM240Q5SV17 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMEM240Q5SV17 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMEM240Q5SV17 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMEM240Q5SV17 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TMEM240Q5SV17 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TMEM240Q5SV17 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TMEM240Q5SV17 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM240Q5SV17 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM240Q5SV17 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM240Q5SV17 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM240Q5SV17 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM240Q5SV17 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM240Q5SV17 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM240Q5SV17 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM240Q5SV17 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM240Q5SV17 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM240Q5SV17 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM240Q5SV17 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM240Q5SV17 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM240Q5SV17 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM240Q5SV17 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM240Q5SV17 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM240Q5SV17 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM240Q5SV17 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM240Q5SV17 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM240Q5SV17 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM240Q5SV17 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM240Q5SV17 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM240Q5SV17 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM240Q5SV17 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM240Q5SV17 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM240Q5SV17 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM240Q5SV17 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM240Q5SV17 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM240Q5SV17 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM240Q5SV17 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM240Q5SV17 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM240Q5SV17 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM240Q5SV17 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM240Q5SV17 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM240Q5SV17 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM240Q5SV17 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM240Q5SV17 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM240Q5SV17 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM240Q5SV17 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM240Q5SV17 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM240Q5SV17 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM240Q5SV17 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM240Q5SV17 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM240Q5SV17 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM240Q5SV17 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM240Q5SV17 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM240Q5SV17 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM240Q5SV17 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM240Q5SV17 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM240Q5SV17 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM240Q5SV17 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM240Q5SV17 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM240Q5SV17 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM240Q5SV17 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM240Q5SV17 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM240Q5SV17 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM240Q5SV17 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM240Q5SV17 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM240Q5SV17 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM240Q5SV17 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM240Q5SV17 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMEM240Q5SV17 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMEM240Q5SV17 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMEM240Q5SV17 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMEM240Q5SV17 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMEM240Q5SV17 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM240Q5SV17 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM240Q5SV17 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM240Q5SV17 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM240Q5SV17 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM240Q5SV17 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM240Q5SV17 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM240Q5SV17 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMEM240Q5SV17 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TMEM240Q5SV17 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMEM240Q5SV17 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms