Protein–RNA interactions for Protein: Q5MIZ7

PPP4R3B, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 3B, humanhuman

Predictions only

Length 849 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R3BQ5MIZ7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PPP4R3BQ5MIZ7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PPP4R3BQ5MIZ7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PPP4R3BQ5MIZ7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PPP4R3BQ5MIZ7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PPP4R3BQ5MIZ7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PPP4R3BQ5MIZ7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PPP4R3BQ5MIZ7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PPP4R3BQ5MIZ7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PPP4R3BQ5MIZ7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PPP4R3BQ5MIZ7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PPP4R3BQ5MIZ7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PPP4R3BQ5MIZ7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PPP4R3BQ5MIZ7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PPP4R3BQ5MIZ7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PPP4R3BQ5MIZ7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
PPP4R3BQ5MIZ7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PPP4R3BQ5MIZ7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PPP4R3BQ5MIZ7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PPP4R3BQ5MIZ7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PPP4R3BQ5MIZ7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PPP4R3BQ5MIZ7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PPP4R3BQ5MIZ7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PPP4R3BQ5MIZ7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PPP4R3BQ5MIZ7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PPP4R3BQ5MIZ7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PPP4R3BQ5MIZ7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PPP4R3BQ5MIZ7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PPP4R3BQ5MIZ7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PPP4R3BQ5MIZ7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PPP4R3BQ5MIZ7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
PPP4R3BQ5MIZ7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PPP4R3BQ5MIZ7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
PPP4R3BQ5MIZ7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PPP4R3BQ5MIZ7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PPP4R3BQ5MIZ7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PPP4R3BQ5MIZ7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PPP4R3BQ5MIZ7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PPP4R3BQ5MIZ7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PPP4R3BQ5MIZ7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PPP4R3BQ5MIZ7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PPP4R3BQ5MIZ7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PPP4R3BQ5MIZ7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PPP4R3BQ5MIZ7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PPP4R3BQ5MIZ7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PPP4R3BQ5MIZ7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PPP4R3BQ5MIZ7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PPP4R3BQ5MIZ7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PPP4R3BQ5MIZ7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PPP4R3BQ5MIZ7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PPP4R3BQ5MIZ7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PPP4R3BQ5MIZ7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PPP4R3BQ5MIZ7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PPP4R3BQ5MIZ7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PPP4R3BQ5MIZ7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PPP4R3BQ5MIZ7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PPP4R3BQ5MIZ7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PPP4R3BQ5MIZ7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PPP4R3BQ5MIZ7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PPP4R3BQ5MIZ7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PPP4R3BQ5MIZ7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PPP4R3BQ5MIZ7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PPP4R3BQ5MIZ7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PPP4R3BQ5MIZ7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PPP4R3BQ5MIZ7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PPP4R3BQ5MIZ7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PPP4R3BQ5MIZ7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PPP4R3BQ5MIZ7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PPP4R3BQ5MIZ7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PPP4R3BQ5MIZ7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PPP4R3BQ5MIZ7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PPP4R3BQ5MIZ7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PPP4R3BQ5MIZ7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PPP4R3BQ5MIZ7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPP4R3BQ5MIZ7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPP4R3BQ5MIZ7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPP4R3BQ5MIZ7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPP4R3BQ5MIZ7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPP4R3BQ5MIZ7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PPP4R3BQ5MIZ7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PPP4R3BQ5MIZ7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PPP4R3BQ5MIZ7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PPP4R3BQ5MIZ7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PPP4R3BQ5MIZ7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PPP4R3BQ5MIZ7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPP4R3BQ5MIZ7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPP4R3BQ5MIZ7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPP4R3BQ5MIZ7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPP4R3BQ5MIZ7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPP4R3BQ5MIZ7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPP4R3BQ5MIZ7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPP4R3BQ5MIZ7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPP4R3BQ5MIZ7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPP4R3BQ5MIZ7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPP4R3BQ5MIZ7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPP4R3BQ5MIZ7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PPP4R3BQ5MIZ7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PPP4R3BQ5MIZ7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PPP4R3BQ5MIZ7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PPP4R3BQ5MIZ7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms