Protein–RNA interactions for Protein: Q5JU00

TCTE1, T-complex-associated testis-expressed protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCTE1Q5JU00 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCTE1Q5JU00 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TCTE1Q5JU00 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TCTE1Q5JU00 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCTE1Q5JU00 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCTE1Q5JU00 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TCTE1Q5JU00 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TCTE1Q5JU00 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCTE1Q5JU00 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCTE1Q5JU00 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCTE1Q5JU00 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCTE1Q5JU00 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCTE1Q5JU00 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCTE1Q5JU00 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCTE1Q5JU00 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCTE1Q5JU00 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TCTE1Q5JU00 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCTE1Q5JU00 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCTE1Q5JU00 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCTE1Q5JU00 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCTE1Q5JU00 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCTE1Q5JU00 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCTE1Q5JU00 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCTE1Q5JU00 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCTE1Q5JU00 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCTE1Q5JU00 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TCTE1Q5JU00 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TCTE1Q5JU00 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCTE1Q5JU00 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCTE1Q5JU00 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TCTE1Q5JU00 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCTE1Q5JU00 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCTE1Q5JU00 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCTE1Q5JU00 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCTE1Q5JU00 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCTE1Q5JU00 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCTE1Q5JU00 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCTE1Q5JU00 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCTE1Q5JU00 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCTE1Q5JU00 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCTE1Q5JU00 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCTE1Q5JU00 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCTE1Q5JU00 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCTE1Q5JU00 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCTE1Q5JU00 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCTE1Q5JU00 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCTE1Q5JU00 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCTE1Q5JU00 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCTE1Q5JU00 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCTE1Q5JU00 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCTE1Q5JU00 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCTE1Q5JU00 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCTE1Q5JU00 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCTE1Q5JU00 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCTE1Q5JU00 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCTE1Q5JU00 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCTE1Q5JU00 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCTE1Q5JU00 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCTE1Q5JU00 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCTE1Q5JU00 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
TCTE1Q5JU00 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCTE1Q5JU00 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCTE1Q5JU00 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TCTE1Q5JU00 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCTE1Q5JU00 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCTE1Q5JU00 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCTE1Q5JU00 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCTE1Q5JU00 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCTE1Q5JU00 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCTE1Q5JU00 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCTE1Q5JU00 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCTE1Q5JU00 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCTE1Q5JU00 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCTE1Q5JU00 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCTE1Q5JU00 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCTE1Q5JU00 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCTE1Q5JU00 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCTE1Q5JU00 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCTE1Q5JU00 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TCTE1Q5JU00 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCTE1Q5JU00 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCTE1Q5JU00 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TCTE1Q5JU00 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TCTE1Q5JU00 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCTE1Q5JU00 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCTE1Q5JU00 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCTE1Q5JU00 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCTE1Q5JU00 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCTE1Q5JU00 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCTE1Q5JU00 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCTE1Q5JU00 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCTE1Q5JU00 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCTE1Q5JU00 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCTE1Q5JU00 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCTE1Q5JU00 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCTE1Q5JU00 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCTE1Q5JU00 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCTE1Q5JU00 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCTE1Q5JU00 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCTE1Q5JU00 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms