Protein–RNA interactions for Protein: Q5IJ48

CRB2, Protein crumbs homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB2Q5IJ48 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRB2Q5IJ48 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRB2Q5IJ48 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRB2Q5IJ48 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRB2Q5IJ48 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRB2Q5IJ48 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRB2Q5IJ48 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRB2Q5IJ48 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRB2Q5IJ48 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRB2Q5IJ48 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRB2Q5IJ48 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRB2Q5IJ48 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRB2Q5IJ48 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CRB2Q5IJ48 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRB2Q5IJ48 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CRB2Q5IJ48 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRB2Q5IJ48 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CRB2Q5IJ48 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRB2Q5IJ48 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRB2Q5IJ48 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRB2Q5IJ48 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRB2Q5IJ48 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRB2Q5IJ48 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRB2Q5IJ48 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRB2Q5IJ48 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRB2Q5IJ48 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRB2Q5IJ48 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRB2Q5IJ48 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRB2Q5IJ48 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRB2Q5IJ48 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRB2Q5IJ48 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRB2Q5IJ48 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRB2Q5IJ48 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRB2Q5IJ48 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRB2Q5IJ48 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRB2Q5IJ48 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRB2Q5IJ48 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRB2Q5IJ48 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CRB2Q5IJ48 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CRB2Q5IJ48 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRB2Q5IJ48 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRB2Q5IJ48 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRB2Q5IJ48 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRB2Q5IJ48 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRB2Q5IJ48 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRB2Q5IJ48 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CRB2Q5IJ48 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRB2Q5IJ48 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRB2Q5IJ48 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRB2Q5IJ48 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRB2Q5IJ48 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRB2Q5IJ48 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRB2Q5IJ48 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRB2Q5IJ48 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRB2Q5IJ48 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRB2Q5IJ48 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRB2Q5IJ48 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRB2Q5IJ48 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRB2Q5IJ48 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRB2Q5IJ48 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRB2Q5IJ48 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRB2Q5IJ48 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRB2Q5IJ48 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CRB2Q5IJ48 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRB2Q5IJ48 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CRB2Q5IJ48 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRB2Q5IJ48 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRB2Q5IJ48 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRB2Q5IJ48 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRB2Q5IJ48 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRB2Q5IJ48 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRB2Q5IJ48 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRB2Q5IJ48 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRB2Q5IJ48 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CRB2Q5IJ48 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRB2Q5IJ48 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRB2Q5IJ48 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRB2Q5IJ48 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CRB2Q5IJ48 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRB2Q5IJ48 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRB2Q5IJ48 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRB2Q5IJ48 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRB2Q5IJ48 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRB2Q5IJ48 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRB2Q5IJ48 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRB2Q5IJ48 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CRB2Q5IJ48 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRB2Q5IJ48 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRB2Q5IJ48 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRB2Q5IJ48 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRB2Q5IJ48 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CRB2Q5IJ48 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRB2Q5IJ48 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRB2Q5IJ48 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRB2Q5IJ48 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRB2Q5IJ48 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRB2Q5IJ48 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRB2Q5IJ48 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRB2Q5IJ48 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRB2Q5IJ48 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms