Protein–RNA interactions for Protein: Q5GH76

XKR4, XK-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 650 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XKR4Q5GH76 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
XKR4Q5GH76 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
XKR4Q5GH76 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
XKR4Q5GH76 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
XKR4Q5GH76 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
XKR4Q5GH76 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
XKR4Q5GH76 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
XKR4Q5GH76 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
XKR4Q5GH76 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
XKR4Q5GH76 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
XKR4Q5GH76 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
XKR4Q5GH76 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
XKR4Q5GH76 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
XKR4Q5GH76 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
XKR4Q5GH76 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
XKR4Q5GH76 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
XKR4Q5GH76 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
XKR4Q5GH76 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
XKR4Q5GH76 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
XKR4Q5GH76 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
XKR4Q5GH76 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
XKR4Q5GH76 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
XKR4Q5GH76 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
XKR4Q5GH76 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
XKR4Q5GH76 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
XKR4Q5GH76 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
XKR4Q5GH76 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
XKR4Q5GH76 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
XKR4Q5GH76 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
XKR4Q5GH76 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
XKR4Q5GH76 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
XKR4Q5GH76 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
XKR4Q5GH76 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
XKR4Q5GH76 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
XKR4Q5GH76 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
XKR4Q5GH76 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
XKR4Q5GH76 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
XKR4Q5GH76 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
XKR4Q5GH76 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
XKR4Q5GH76 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
XKR4Q5GH76 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
XKR4Q5GH76 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
XKR4Q5GH76 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
XKR4Q5GH76 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
XKR4Q5GH76 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
XKR4Q5GH76 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
XKR4Q5GH76 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
XKR4Q5GH76 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
XKR4Q5GH76 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
XKR4Q5GH76 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
XKR4Q5GH76 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
XKR4Q5GH76 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
XKR4Q5GH76 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
XKR4Q5GH76 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
XKR4Q5GH76 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
XKR4Q5GH76 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
XKR4Q5GH76 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
XKR4Q5GH76 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
XKR4Q5GH76 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
XKR4Q5GH76 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
XKR4Q5GH76 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
XKR4Q5GH76 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
XKR4Q5GH76 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
XKR4Q5GH76 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
XKR4Q5GH76 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
XKR4Q5GH76 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
XKR4Q5GH76 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
XKR4Q5GH76 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
XKR4Q5GH76 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
XKR4Q5GH76 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
XKR4Q5GH76 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
XKR4Q5GH76 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
XKR4Q5GH76 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
XKR4Q5GH76 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
XKR4Q5GH76 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
XKR4Q5GH76 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
XKR4Q5GH76 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
XKR4Q5GH76 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
XKR4Q5GH76 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
XKR4Q5GH76 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
XKR4Q5GH76 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
XKR4Q5GH76 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
XKR4Q5GH76 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
XKR4Q5GH76 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
XKR4Q5GH76 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
XKR4Q5GH76 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
XKR4Q5GH76 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
XKR4Q5GH76 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
XKR4Q5GH76 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
XKR4Q5GH76 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
XKR4Q5GH76 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
XKR4Q5GH76 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
XKR4Q5GH76 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
XKR4Q5GH76 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
XKR4Q5GH76 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
XKR4Q5GH76 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
XKR4Q5GH76 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
XKR4Q5GH76 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
XKR4Q5GH76 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
XKR4Q5GH76 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms