Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBM0

CMPK2, UMP-CMP kinase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK2Q5EBM0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CMPK2Q5EBM0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CMPK2Q5EBM0 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CMPK2Q5EBM0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CMPK2Q5EBM0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CMPK2Q5EBM0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CMPK2Q5EBM0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CMPK2Q5EBM0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CMPK2Q5EBM0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CMPK2Q5EBM0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CMPK2Q5EBM0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CMPK2Q5EBM0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CMPK2Q5EBM0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CMPK2Q5EBM0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CMPK2Q5EBM0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CMPK2Q5EBM0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CMPK2Q5EBM0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CMPK2Q5EBM0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CMPK2Q5EBM0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CMPK2Q5EBM0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CMPK2Q5EBM0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CMPK2Q5EBM0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CMPK2Q5EBM0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CMPK2Q5EBM0 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CMPK2Q5EBM0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CMPK2Q5EBM0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CMPK2Q5EBM0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CMPK2Q5EBM0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CMPK2Q5EBM0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CMPK2Q5EBM0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CMPK2Q5EBM0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CMPK2Q5EBM0 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CMPK2Q5EBM0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CMPK2Q5EBM0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CMPK2Q5EBM0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CMPK2Q5EBM0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CMPK2Q5EBM0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CMPK2Q5EBM0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CMPK2Q5EBM0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CMPK2Q5EBM0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CMPK2Q5EBM0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CMPK2Q5EBM0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CMPK2Q5EBM0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CMPK2Q5EBM0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CMPK2Q5EBM0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CMPK2Q5EBM0 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CMPK2Q5EBM0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CMPK2Q5EBM0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CMPK2Q5EBM0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CMPK2Q5EBM0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CMPK2Q5EBM0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CMPK2Q5EBM0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CMPK2Q5EBM0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CMPK2Q5EBM0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CMPK2Q5EBM0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CMPK2Q5EBM0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CMPK2Q5EBM0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CMPK2Q5EBM0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CMPK2Q5EBM0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CMPK2Q5EBM0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CMPK2Q5EBM0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CMPK2Q5EBM0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CMPK2Q5EBM0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CMPK2Q5EBM0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CMPK2Q5EBM0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CMPK2Q5EBM0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CMPK2Q5EBM0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CMPK2Q5EBM0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CMPK2Q5EBM0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CMPK2Q5EBM0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CMPK2Q5EBM0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CMPK2Q5EBM0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CMPK2Q5EBM0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CMPK2Q5EBM0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CMPK2Q5EBM0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CMPK2Q5EBM0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CMPK2Q5EBM0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CMPK2Q5EBM0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CMPK2Q5EBM0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CMPK2Q5EBM0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CMPK2Q5EBM0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CMPK2Q5EBM0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CMPK2Q5EBM0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CMPK2Q5EBM0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CMPK2Q5EBM0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CMPK2Q5EBM0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CMPK2Q5EBM0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CMPK2Q5EBM0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CMPK2Q5EBM0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CMPK2Q5EBM0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CMPK2Q5EBM0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CMPK2Q5EBM0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CMPK2Q5EBM0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CMPK2Q5EBM0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CMPK2Q5EBM0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CMPK2Q5EBM0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CMPK2Q5EBM0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CMPK2Q5EBM0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CMPK2Q5EBM0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CMPK2Q5EBM0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms