Protein–RNA interactions for Protein: Q53HC0

CCDC92, Coiled-coil domain-containing protein 92, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC92Q53HC0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC92Q53HC0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC92Q53HC0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC92Q53HC0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC92Q53HC0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC92Q53HC0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC92Q53HC0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC92Q53HC0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC92Q53HC0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC92Q53HC0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC92Q53HC0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC92Q53HC0 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC92Q53HC0 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC92Q53HC0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC92Q53HC0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC92Q53HC0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC92Q53HC0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC92Q53HC0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC92Q53HC0 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC92Q53HC0 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC92Q53HC0 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC92Q53HC0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC92Q53HC0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCDC92Q53HC0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCDC92Q53HC0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC92Q53HC0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC92Q53HC0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC92Q53HC0 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC92Q53HC0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC92Q53HC0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC92Q53HC0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC92Q53HC0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC92Q53HC0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC92Q53HC0 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC92Q53HC0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC92Q53HC0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC92Q53HC0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC92Q53HC0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC92Q53HC0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC92Q53HC0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC92Q53HC0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC92Q53HC0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC92Q53HC0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC92Q53HC0 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC92Q53HC0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC92Q53HC0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC92Q53HC0 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC92Q53HC0 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC92Q53HC0 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC92Q53HC0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC92Q53HC0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC92Q53HC0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC92Q53HC0 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC92Q53HC0 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC92Q53HC0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC92Q53HC0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC92Q53HC0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC92Q53HC0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC92Q53HC0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC92Q53HC0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC92Q53HC0 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC92Q53HC0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC92Q53HC0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC92Q53HC0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC92Q53HC0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC92Q53HC0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC92Q53HC0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC92Q53HC0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC92Q53HC0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC92Q53HC0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC92Q53HC0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC92Q53HC0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC92Q53HC0 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC92Q53HC0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC92Q53HC0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC92Q53HC0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC92Q53HC0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC92Q53HC0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC92Q53HC0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC92Q53HC0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC92Q53HC0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC92Q53HC0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC92Q53HC0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC92Q53HC0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC92Q53HC0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC92Q53HC0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC92Q53HC0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC92Q53HC0 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC92Q53HC0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC92Q53HC0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC92Q53HC0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC92Q53HC0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC92Q53HC0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC92Q53HC0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC92Q53HC0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC92Q53HC0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC92Q53HC0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC92Q53HC0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC92Q53HC0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC92Q53HC0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms