Protein–RNA interactions for Protein: Q53GI3

ZNF394, Zinc finger protein 394, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF394Q53GI3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZNF394Q53GI3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZNF394Q53GI3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZNF394Q53GI3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZNF394Q53GI3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZNF394Q53GI3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ZNF394Q53GI3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ZNF394Q53GI3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ZNF394Q53GI3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ZNF394Q53GI3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNF394Q53GI3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNF394Q53GI3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNF394Q53GI3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNF394Q53GI3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNF394Q53GI3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNF394Q53GI3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNF394Q53GI3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNF394Q53GI3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNF394Q53GI3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNF394Q53GI3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNF394Q53GI3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF394Q53GI3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF394Q53GI3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF394Q53GI3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF394Q53GI3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF394Q53GI3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF394Q53GI3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF394Q53GI3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF394Q53GI3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF394Q53GI3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF394Q53GI3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF394Q53GI3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF394Q53GI3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF394Q53GI3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF394Q53GI3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF394Q53GI3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF394Q53GI3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF394Q53GI3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF394Q53GI3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF394Q53GI3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF394Q53GI3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF394Q53GI3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF394Q53GI3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNF394Q53GI3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNF394Q53GI3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNF394Q53GI3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNF394Q53GI3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNF394Q53GI3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNF394Q53GI3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNF394Q53GI3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNF394Q53GI3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF394Q53GI3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF394Q53GI3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF394Q53GI3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF394Q53GI3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF394Q53GI3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF394Q53GI3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF394Q53GI3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF394Q53GI3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF394Q53GI3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF394Q53GI3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF394Q53GI3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF394Q53GI3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF394Q53GI3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF394Q53GI3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF394Q53GI3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF394Q53GI3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF394Q53GI3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF394Q53GI3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF394Q53GI3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF394Q53GI3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF394Q53GI3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF394Q53GI3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF394Q53GI3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF394Q53GI3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF394Q53GI3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF394Q53GI3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF394Q53GI3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF394Q53GI3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF394Q53GI3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF394Q53GI3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF394Q53GI3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF394Q53GI3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF394Q53GI3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF394Q53GI3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF394Q53GI3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF394Q53GI3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF394Q53GI3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF394Q53GI3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF394Q53GI3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF394Q53GI3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF394Q53GI3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF394Q53GI3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF394Q53GI3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF394Q53GI3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF394Q53GI3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF394Q53GI3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF394Q53GI3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF394Q53GI3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF394Q53GI3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms