Protein–RNA interactions for Protein: Q52WX2

SBK1, Serine/threonine-protein kinase SBK1, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBK1Q52WX2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SBK1Q52WX2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SBK1Q52WX2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SBK1Q52WX2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SBK1Q52WX2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SBK1Q52WX2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SBK1Q52WX2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SBK1Q52WX2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SBK1Q52WX2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SBK1Q52WX2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SBK1Q52WX2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SBK1Q52WX2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SBK1Q52WX2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SBK1Q52WX2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SBK1Q52WX2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SBK1Q52WX2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SBK1Q52WX2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SBK1Q52WX2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SBK1Q52WX2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SBK1Q52WX2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SBK1Q52WX2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
SBK1Q52WX2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SBK1Q52WX2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SBK1Q52WX2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SBK1Q52WX2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SBK1Q52WX2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SBK1Q52WX2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SBK1Q52WX2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SBK1Q52WX2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SBK1Q52WX2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SBK1Q52WX2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SBK1Q52WX2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SBK1Q52WX2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SBK1Q52WX2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SBK1Q52WX2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SBK1Q52WX2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SBK1Q52WX2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SBK1Q52WX2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SBK1Q52WX2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SBK1Q52WX2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SBK1Q52WX2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SBK1Q52WX2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SBK1Q52WX2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SBK1Q52WX2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SBK1Q52WX2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SBK1Q52WX2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SBK1Q52WX2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SBK1Q52WX2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SBK1Q52WX2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SBK1Q52WX2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SBK1Q52WX2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SBK1Q52WX2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SBK1Q52WX2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SBK1Q52WX2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SBK1Q52WX2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SBK1Q52WX2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SBK1Q52WX2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SBK1Q52WX2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SBK1Q52WX2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SBK1Q52WX2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SBK1Q52WX2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SBK1Q52WX2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SBK1Q52WX2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SBK1Q52WX2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SBK1Q52WX2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SBK1Q52WX2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SBK1Q52WX2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SBK1Q52WX2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SBK1Q52WX2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SBK1Q52WX2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SBK1Q52WX2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SBK1Q52WX2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SBK1Q52WX2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SBK1Q52WX2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SBK1Q52WX2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
SBK1Q52WX2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SBK1Q52WX2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SBK1Q52WX2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SBK1Q52WX2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SBK1Q52WX2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SBK1Q52WX2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SBK1Q52WX2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SBK1Q52WX2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SBK1Q52WX2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SBK1Q52WX2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SBK1Q52WX2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SBK1Q52WX2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SBK1Q52WX2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SBK1Q52WX2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SBK1Q52WX2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SBK1Q52WX2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SBK1Q52WX2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SBK1Q52WX2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SBK1Q52WX2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SBK1Q52WX2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SBK1Q52WX2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SBK1Q52WX2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SBK1Q52WX2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SBK1Q52WX2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SBK1Q52WX2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms