Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTXN3Q4LDR2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTXN3Q4LDR2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTXN3Q4LDR2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTXN3Q4LDR2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTXN3Q4LDR2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTXN3Q4LDR2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTXN3Q4LDR2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTXN3Q4LDR2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTXN3Q4LDR2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTXN3Q4LDR2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTXN3Q4LDR2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTXN3Q4LDR2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTXN3Q4LDR2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTXN3Q4LDR2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CTXN3Q4LDR2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CTXN3Q4LDR2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
CTXN3Q4LDR2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CTXN3Q4LDR2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CTXN3Q4LDR2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CTXN3Q4LDR2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CTXN3Q4LDR2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTXN3Q4LDR2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTXN3Q4LDR2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTXN3Q4LDR2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTXN3Q4LDR2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CTXN3Q4LDR2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTXN3Q4LDR2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTXN3Q4LDR2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTXN3Q4LDR2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTXN3Q4LDR2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTXN3Q4LDR2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTXN3Q4LDR2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTXN3Q4LDR2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTXN3Q4LDR2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTXN3Q4LDR2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTXN3Q4LDR2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTXN3Q4LDR2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTXN3Q4LDR2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTXN3Q4LDR2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTXN3Q4LDR2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTXN3Q4LDR2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTXN3Q4LDR2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTXN3Q4LDR2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CTXN3Q4LDR2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTXN3Q4LDR2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTXN3Q4LDR2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTXN3Q4LDR2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTXN3Q4LDR2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTXN3Q4LDR2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTXN3Q4LDR2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTXN3Q4LDR2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTXN3Q4LDR2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CTXN3Q4LDR2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTXN3Q4LDR2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTXN3Q4LDR2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CTXN3Q4LDR2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTXN3Q4LDR2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTXN3Q4LDR2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTXN3Q4LDR2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTXN3Q4LDR2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CTXN3Q4LDR2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTXN3Q4LDR2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTXN3Q4LDR2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CTXN3Q4LDR2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTXN3Q4LDR2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTXN3Q4LDR2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTXN3Q4LDR2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTXN3Q4LDR2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTXN3Q4LDR2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTXN3Q4LDR2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTXN3Q4LDR2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTXN3Q4LDR2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTXN3Q4LDR2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTXN3Q4LDR2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTXN3Q4LDR2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTXN3Q4LDR2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTXN3Q4LDR2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTXN3Q4LDR2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTXN3Q4LDR2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTXN3Q4LDR2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTXN3Q4LDR2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTXN3Q4LDR2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTXN3Q4LDR2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CTXN3Q4LDR2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CTXN3Q4LDR2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CTXN3Q4LDR2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CTXN3Q4LDR2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CTXN3Q4LDR2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTXN3Q4LDR2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTXN3Q4LDR2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTXN3Q4LDR2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CTXN3Q4LDR2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTXN3Q4LDR2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTXN3Q4LDR2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CTXN3Q4LDR2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CTXN3Q4LDR2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CTXN3Q4LDR2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CTXN3Q4LDR2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTXN3Q4LDR2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms