Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

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Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TPRNQ4KMQ1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TPRNQ4KMQ1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TPRNQ4KMQ1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TPRNQ4KMQ1 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TPRNQ4KMQ1 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
TPRNQ4KMQ1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TPRNQ4KMQ1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TPRNQ4KMQ1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TPRNQ4KMQ1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TPRNQ4KMQ1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
TPRNQ4KMQ1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TPRNQ4KMQ1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TPRNQ4KMQ1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TPRNQ4KMQ1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TPRNQ4KMQ1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TPRNQ4KMQ1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TPRNQ4KMQ1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TPRNQ4KMQ1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TPRNQ4KMQ1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TPRNQ4KMQ1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
TPRNQ4KMQ1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TPRNQ4KMQ1 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TPRNQ4KMQ1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TPRNQ4KMQ1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TPRNQ4KMQ1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TPRNQ4KMQ1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TPRNQ4KMQ1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TPRNQ4KMQ1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TPRNQ4KMQ1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TPRNQ4KMQ1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TPRNQ4KMQ1 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TPRNQ4KMQ1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TPRNQ4KMQ1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TPRNQ4KMQ1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TPRNQ4KMQ1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TPRNQ4KMQ1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TPRNQ4KMQ1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TPRNQ4KMQ1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TPRNQ4KMQ1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TPRNQ4KMQ1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TPRNQ4KMQ1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TPRNQ4KMQ1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TPRNQ4KMQ1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TPRNQ4KMQ1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TPRNQ4KMQ1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TPRNQ4KMQ1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TPRNQ4KMQ1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TPRNQ4KMQ1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TPRNQ4KMQ1 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TPRNQ4KMQ1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TPRNQ4KMQ1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TPRNQ4KMQ1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TPRNQ4KMQ1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TPRNQ4KMQ1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TPRNQ4KMQ1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TPRNQ4KMQ1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TPRNQ4KMQ1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TPRNQ4KMQ1 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TPRNQ4KMQ1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TPRNQ4KMQ1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TPRNQ4KMQ1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TPRNQ4KMQ1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TPRNQ4KMQ1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TPRNQ4KMQ1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TPRNQ4KMQ1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TPRNQ4KMQ1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TPRNQ4KMQ1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TPRNQ4KMQ1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TPRNQ4KMQ1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TPRNQ4KMQ1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TPRNQ4KMQ1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TPRNQ4KMQ1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TPRNQ4KMQ1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TPRNQ4KMQ1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TPRNQ4KMQ1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TPRNQ4KMQ1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TPRNQ4KMQ1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TPRNQ4KMQ1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TPRNQ4KMQ1 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TPRNQ4KMQ1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TPRNQ4KMQ1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TPRNQ4KMQ1 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TPRNQ4KMQ1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TPRNQ4KMQ1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TPRNQ4KMQ1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TPRNQ4KMQ1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TPRNQ4KMQ1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TPRNQ4KMQ1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TPRNQ4KMQ1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TPRNQ4KMQ1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TPRNQ4KMQ1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TPRNQ4KMQ1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TPRNQ4KMQ1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TPRNQ4KMQ1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TPRNQ4KMQ1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TPRNQ4KMQ1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TPRNQ4KMQ1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TPRNQ4KMQ1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TPRNQ4KMQ1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
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