Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
DUSP28Q4G0W2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DUSP28Q4G0W2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DUSP28Q4G0W2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
DUSP28Q4G0W2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DUSP28Q4G0W2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DUSP28Q4G0W2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
DUSP28Q4G0W2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DUSP28Q4G0W2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DUSP28Q4G0W2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DUSP28Q4G0W2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DUSP28Q4G0W2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DUSP28Q4G0W2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
DUSP28Q4G0W2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
DUSP28Q4G0W2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
DUSP28Q4G0W2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
DUSP28Q4G0W2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
DUSP28Q4G0W2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
DUSP28Q4G0W2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
DUSP28Q4G0W2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DUSP28Q4G0W2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DUSP28Q4G0W2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DUSP28Q4G0W2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DUSP28Q4G0W2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DUSP28Q4G0W2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DUSP28Q4G0W2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DUSP28Q4G0W2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DUSP28Q4G0W2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DUSP28Q4G0W2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DUSP28Q4G0W2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
DUSP28Q4G0W2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DUSP28Q4G0W2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DUSP28Q4G0W2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DUSP28Q4G0W2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DUSP28Q4G0W2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
DUSP28Q4G0W2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DUSP28Q4G0W2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
DUSP28Q4G0W2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
DUSP28Q4G0W2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DUSP28Q4G0W2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DUSP28Q4G0W2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DUSP28Q4G0W2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DUSP28Q4G0W2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DUSP28Q4G0W2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DUSP28Q4G0W2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DUSP28Q4G0W2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DUSP28Q4G0W2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DUSP28Q4G0W2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DUSP28Q4G0W2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
DUSP28Q4G0W2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DUSP28Q4G0W2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DUSP28Q4G0W2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
DUSP28Q4G0W2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
DUSP28Q4G0W2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
DUSP28Q4G0W2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
DUSP28Q4G0W2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
DUSP28Q4G0W2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DUSP28Q4G0W2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DUSP28Q4G0W2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DUSP28Q4G0W2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DUSP28Q4G0W2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DUSP28Q4G0W2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DUSP28Q4G0W2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DUSP28Q4G0W2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DUSP28Q4G0W2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DUSP28Q4G0W2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DUSP28Q4G0W2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DUSP28Q4G0W2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
DUSP28Q4G0W2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DUSP28Q4G0W2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DUSP28Q4G0W2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DUSP28Q4G0W2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DUSP28Q4G0W2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DUSP28Q4G0W2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DUSP28Q4G0W2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DUSP28Q4G0W2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DUSP28Q4G0W2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DUSP28Q4G0W2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
DUSP28Q4G0W2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DUSP28Q4G0W2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DUSP28Q4G0W2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DUSP28Q4G0W2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
DUSP28Q4G0W2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DUSP28Q4G0W2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DUSP28Q4G0W2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DUSP28Q4G0W2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DUSP28Q4G0W2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DUSP28Q4G0W2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DUSP28Q4G0W2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DUSP28Q4G0W2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
DUSP28Q4G0W2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
DUSP28Q4G0W2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DUSP28Q4G0W2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
DUSP28Q4G0W2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
DUSP28Q4G0W2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DUSP28Q4G0W2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
DUSP28Q4G0W2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
DUSP28Q4G0W2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
DUSP28Q4G0W2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
DUSP28Q4G0W2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms