Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0U5

CFAP221, Cilia- and flagella-associated protein 221, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP221Q4G0U5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CFAP221Q4G0U5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CFAP221Q4G0U5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CFAP221Q4G0U5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CFAP221Q4G0U5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CFAP221Q4G0U5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CFAP221Q4G0U5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CFAP221Q4G0U5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CFAP221Q4G0U5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CFAP221Q4G0U5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CFAP221Q4G0U5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CFAP221Q4G0U5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CFAP221Q4G0U5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CFAP221Q4G0U5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CFAP221Q4G0U5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CFAP221Q4G0U5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CFAP221Q4G0U5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFAP221Q4G0U5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFAP221Q4G0U5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFAP221Q4G0U5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFAP221Q4G0U5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CFAP221Q4G0U5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CFAP221Q4G0U5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CFAP221Q4G0U5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CFAP221Q4G0U5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CFAP221Q4G0U5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CFAP221Q4G0U5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CFAP221Q4G0U5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CFAP221Q4G0U5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CFAP221Q4G0U5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CFAP221Q4G0U5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CFAP221Q4G0U5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CFAP221Q4G0U5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CFAP221Q4G0U5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CFAP221Q4G0U5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CFAP221Q4G0U5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CFAP221Q4G0U5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFAP221Q4G0U5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFAP221Q4G0U5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFAP221Q4G0U5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFAP221Q4G0U5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFAP221Q4G0U5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFAP221Q4G0U5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CFAP221Q4G0U5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CFAP221Q4G0U5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CFAP221Q4G0U5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CFAP221Q4G0U5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CFAP221Q4G0U5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CFAP221Q4G0U5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CFAP221Q4G0U5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CFAP221Q4G0U5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CFAP221Q4G0U5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CFAP221Q4G0U5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CFAP221Q4G0U5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CFAP221Q4G0U5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CFAP221Q4G0U5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CFAP221Q4G0U5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CFAP221Q4G0U5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CFAP221Q4G0U5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CFAP221Q4G0U5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CFAP221Q4G0U5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CFAP221Q4G0U5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CFAP221Q4G0U5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CFAP221Q4G0U5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CFAP221Q4G0U5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CFAP221Q4G0U5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CFAP221Q4G0U5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CFAP221Q4G0U5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CFAP221Q4G0U5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CFAP221Q4G0U5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CFAP221Q4G0U5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CFAP221Q4G0U5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CFAP221Q4G0U5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CFAP221Q4G0U5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CFAP221Q4G0U5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CFAP221Q4G0U5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CFAP221Q4G0U5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CFAP221Q4G0U5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CFAP221Q4G0U5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CFAP221Q4G0U5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CFAP221Q4G0U5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CFAP221Q4G0U5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CFAP221Q4G0U5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CFAP221Q4G0U5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CFAP221Q4G0U5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CFAP221Q4G0U5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CFAP221Q4G0U5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CFAP221Q4G0U5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CFAP221Q4G0U5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CFAP221Q4G0U5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CFAP221Q4G0U5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CFAP221Q4G0U5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CFAP221Q4G0U5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CFAP221Q4G0U5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CFAP221Q4G0U5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CFAP221Q4G0U5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CFAP221Q4G0U5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CFAP221Q4G0U5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CFAP221Q4G0U5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CFAP221Q4G0U5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms