Protein–RNA interactions for Protein: Q496Y0

LONRF3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF3Q496Y0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LONRF3Q496Y0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LONRF3Q496Y0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LONRF3Q496Y0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LONRF3Q496Y0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LONRF3Q496Y0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LONRF3Q496Y0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LONRF3Q496Y0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LONRF3Q496Y0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LONRF3Q496Y0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LONRF3Q496Y0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LONRF3Q496Y0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LONRF3Q496Y0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LONRF3Q496Y0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
LONRF3Q496Y0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LONRF3Q496Y0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LONRF3Q496Y0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LONRF3Q496Y0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LONRF3Q496Y0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LONRF3Q496Y0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
LONRF3Q496Y0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LONRF3Q496Y0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LONRF3Q496Y0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LONRF3Q496Y0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LONRF3Q496Y0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LONRF3Q496Y0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LONRF3Q496Y0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LONRF3Q496Y0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LONRF3Q496Y0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LONRF3Q496Y0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
LONRF3Q496Y0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
LONRF3Q496Y0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
LONRF3Q496Y0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
LONRF3Q496Y0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LONRF3Q496Y0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LONRF3Q496Y0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LONRF3Q496Y0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LONRF3Q496Y0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LONRF3Q496Y0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LONRF3Q496Y0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LONRF3Q496Y0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LONRF3Q496Y0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LONRF3Q496Y0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LONRF3Q496Y0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LONRF3Q496Y0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
LONRF3Q496Y0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LONRF3Q496Y0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LONRF3Q496Y0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LONRF3Q496Y0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LONRF3Q496Y0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LONRF3Q496Y0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LONRF3Q496Y0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LONRF3Q496Y0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LONRF3Q496Y0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LONRF3Q496Y0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LONRF3Q496Y0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LONRF3Q496Y0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LONRF3Q496Y0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
LONRF3Q496Y0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
LONRF3Q496Y0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LONRF3Q496Y0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LONRF3Q496Y0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LONRF3Q496Y0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LONRF3Q496Y0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LONRF3Q496Y0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LONRF3Q496Y0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LONRF3Q496Y0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LONRF3Q496Y0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LONRF3Q496Y0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LONRF3Q496Y0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LONRF3Q496Y0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LONRF3Q496Y0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LONRF3Q496Y0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LONRF3Q496Y0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LONRF3Q496Y0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LONRF3Q496Y0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LONRF3Q496Y0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LONRF3Q496Y0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LONRF3Q496Y0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LONRF3Q496Y0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LONRF3Q496Y0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LONRF3Q496Y0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LONRF3Q496Y0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LONRF3Q496Y0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LONRF3Q496Y0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LONRF3Q496Y0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LONRF3Q496Y0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
LONRF3Q496Y0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LONRF3Q496Y0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LONRF3Q496Y0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LONRF3Q496Y0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LONRF3Q496Y0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LONRF3Q496Y0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LONRF3Q496Y0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LONRF3Q496Y0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LONRF3Q496Y0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LONRF3Q496Y0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LONRF3Q496Y0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LONRF3Q496Y0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LONRF3Q496Y0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms