Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY84

KRT71, Keratin, type II cytoskeletal 71, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT71Q3SY84 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT71Q3SY84 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT71Q3SY84 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT71Q3SY84 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT71Q3SY84 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT71Q3SY84 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT71Q3SY84 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT71Q3SY84 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT71Q3SY84 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT71Q3SY84 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT71Q3SY84 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT71Q3SY84 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT71Q3SY84 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT71Q3SY84 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT71Q3SY84 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT71Q3SY84 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT71Q3SY84 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT71Q3SY84 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT71Q3SY84 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT71Q3SY84 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT71Q3SY84 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT71Q3SY84 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT71Q3SY84 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT71Q3SY84 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT71Q3SY84 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT71Q3SY84 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT71Q3SY84 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT71Q3SY84 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT71Q3SY84 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT71Q3SY84 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT71Q3SY84 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT71Q3SY84 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT71Q3SY84 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT71Q3SY84 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT71Q3SY84 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT71Q3SY84 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT71Q3SY84 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KRT71Q3SY84 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KRT71Q3SY84 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KRT71Q3SY84 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KRT71Q3SY84 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
KRT71Q3SY84 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
KRT71Q3SY84 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRT71Q3SY84 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRT71Q3SY84 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRT71Q3SY84 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRT71Q3SY84 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
KRT71Q3SY84 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRT71Q3SY84 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRT71Q3SY84 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRT71Q3SY84 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
KRT71Q3SY84 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KRT71Q3SY84 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KRT71Q3SY84 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KRT71Q3SY84 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KRT71Q3SY84 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KRT71Q3SY84 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KRT71Q3SY84 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KRT71Q3SY84 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KRT71Q3SY84 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KRT71Q3SY84 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KRT71Q3SY84 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KRT71Q3SY84 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KRT71Q3SY84 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KRT71Q3SY84 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KRT71Q3SY84 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KRT71Q3SY84 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KRT71Q3SY84 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KRT71Q3SY84 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KRT71Q3SY84 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KRT71Q3SY84 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KRT71Q3SY84 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KRT71Q3SY84 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KRT71Q3SY84 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KRT71Q3SY84 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KRT71Q3SY84 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KRT71Q3SY84 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KRT71Q3SY84 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KRT71Q3SY84 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KRT71Q3SY84 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
KRT71Q3SY84 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRT71Q3SY84 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRT71Q3SY84 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRT71Q3SY84 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRT71Q3SY84 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRT71Q3SY84 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRT71Q3SY84 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
KRT71Q3SY84 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT71Q3SY84 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT71Q3SY84 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT71Q3SY84 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT71Q3SY84 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT71Q3SY84 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT71Q3SY84 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT71Q3SY84 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT71Q3SY84 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT71Q3SY84 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT71Q3SY84 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT71Q3SY84 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT71Q3SY84 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms