Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SP6Q3SY56 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SP6Q3SY56 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SP6Q3SY56 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SP6Q3SY56 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SP6Q3SY56 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SP6Q3SY56 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SP6Q3SY56 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SP6Q3SY56 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SP6Q3SY56 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SP6Q3SY56 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SP6Q3SY56 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SP6Q3SY56 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SP6Q3SY56 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SP6Q3SY56 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SP6Q3SY56 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SP6Q3SY56 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SP6Q3SY56 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SP6Q3SY56 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SP6Q3SY56 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SP6Q3SY56 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SP6Q3SY56 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SP6Q3SY56 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SP6Q3SY56 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SP6Q3SY56 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SP6Q3SY56 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SP6Q3SY56 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SP6Q3SY56 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SP6Q3SY56 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SP6Q3SY56 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SP6Q3SY56 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SP6Q3SY56 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SP6Q3SY56 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SP6Q3SY56 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SP6Q3SY56 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SP6Q3SY56 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SP6Q3SY56 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SP6Q3SY56 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SP6Q3SY56 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SP6Q3SY56 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SP6Q3SY56 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SP6Q3SY56 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SP6Q3SY56 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SP6Q3SY56 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SP6Q3SY56 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SP6Q3SY56 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SP6Q3SY56 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SP6Q3SY56 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SP6Q3SY56 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SP6Q3SY56 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SP6Q3SY56 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SP6Q3SY56 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SP6Q3SY56 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SP6Q3SY56 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SP6Q3SY56 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SP6Q3SY56 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SP6Q3SY56 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SP6Q3SY56 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SP6Q3SY56 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SP6Q3SY56 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SP6Q3SY56 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SP6Q3SY56 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SP6Q3SY56 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SP6Q3SY56 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SP6Q3SY56 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SP6Q3SY56 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SP6Q3SY56 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SP6Q3SY56 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SP6Q3SY56 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SP6Q3SY56 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SP6Q3SY56 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SP6Q3SY56 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SP6Q3SY56 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SP6Q3SY56 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SP6Q3SY56 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SP6Q3SY56 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SP6Q3SY56 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SP6Q3SY56 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SP6Q3SY56 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SP6Q3SY56 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SP6Q3SY56 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SP6Q3SY56 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SP6Q3SY56 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SP6Q3SY56 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SP6Q3SY56 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SP6Q3SY56 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SP6Q3SY56 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SP6Q3SY56 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SP6Q3SY56 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SP6Q3SY56 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SP6Q3SY56 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SP6Q3SY56 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SP6Q3SY56 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SP6Q3SY56 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SP6Q3SY56 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SP6Q3SY56 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SP6Q3SY56 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SP6Q3SY56 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SP6Q3SY56 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SP6Q3SY56 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.4 ms