Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

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Length 58 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KRTAP21-3Q3LHN1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KRTAP21-3Q3LHN1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KRTAP21-3Q3LHN1 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KRTAP21-3Q3LHN1 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KRTAP21-3Q3LHN1 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KRTAP21-3Q3LHN1 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
KRTAP21-3Q3LHN1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KRTAP21-3Q3LHN1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KRTAP21-3Q3LHN1 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KRTAP21-3Q3LHN1 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KRTAP21-3Q3LHN1 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
KRTAP21-3Q3LHN1 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KRTAP21-3Q3LHN1 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KRTAP21-3Q3LHN1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KRTAP21-3Q3LHN1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KRTAP21-3Q3LHN1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KRTAP21-3Q3LHN1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KRTAP21-3Q3LHN1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KRTAP21-3Q3LHN1 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KRTAP21-3Q3LHN1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KRTAP21-3Q3LHN1 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
KRTAP21-3Q3LHN1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KRTAP21-3Q3LHN1 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KRTAP21-3Q3LHN1 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
KRTAP21-3Q3LHN1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KRTAP21-3Q3LHN1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KRTAP21-3Q3LHN1 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KRTAP21-3Q3LHN1 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
KRTAP21-3Q3LHN1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KRTAP21-3Q3LHN1 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KRTAP21-3Q3LHN1 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KRTAP21-3Q3LHN1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KRTAP21-3Q3LHN1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KRTAP21-3Q3LHN1 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KRTAP21-3Q3LHN1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KRTAP21-3Q3LHN1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
KRTAP21-3Q3LHN1 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
KRTAP21-3Q3LHN1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KRTAP21-3Q3LHN1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KRTAP21-3Q3LHN1 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
KRTAP21-3Q3LHN1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
KRTAP21-3Q3LHN1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KRTAP21-3Q3LHN1 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KRTAP21-3Q3LHN1 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KRTAP21-3Q3LHN1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KRTAP21-3Q3LHN1 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KRTAP21-3Q3LHN1 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KRTAP21-3Q3LHN1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KRTAP21-3Q3LHN1 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KRTAP21-3Q3LHN1 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KRTAP21-3Q3LHN1 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KRTAP21-3Q3LHN1 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KRTAP21-3Q3LHN1 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KRTAP21-3Q3LHN1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KRTAP21-3Q3LHN1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KRTAP21-3Q3LHN1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KRTAP21-3Q3LHN1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KRTAP21-3Q3LHN1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KRTAP21-3Q3LHN1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KRTAP21-3Q3LHN1 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
KRTAP21-3Q3LHN1 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KRTAP21-3Q3LHN1 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KRTAP21-3Q3LHN1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KRTAP21-3Q3LHN1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KRTAP21-3Q3LHN1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KRTAP21-3Q3LHN1 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KRTAP21-3Q3LHN1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
KRTAP21-3Q3LHN1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KRTAP21-3Q3LHN1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
KRTAP21-3Q3LHN1 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
KRTAP21-3Q3LHN1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KRTAP21-3Q3LHN1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KRTAP21-3Q3LHN1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KRTAP21-3Q3LHN1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KRTAP21-3Q3LHN1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KRTAP21-3Q3LHN1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KRTAP21-3Q3LHN1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KRTAP21-3Q3LHN1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KRTAP21-3Q3LHN1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KRTAP21-3Q3LHN1 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
KRTAP21-3Q3LHN1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KRTAP21-3Q3LHN1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KRTAP21-3Q3LHN1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KRTAP21-3Q3LHN1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
KRTAP21-3Q3LHN1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
KRTAP21-3Q3LHN1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
KRTAP21-3Q3LHN1 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
KRTAP21-3Q3LHN1 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
KRTAP21-3Q3LHN1 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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