Protein–RNA interactions for Protein: Q3LFD5

USP41, Putative ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 41, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP41Q3LFD5 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP41Q3LFD5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP41Q3LFD5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP41Q3LFD5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP41Q3LFD5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP41Q3LFD5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP41Q3LFD5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP41Q3LFD5 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP41Q3LFD5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP41Q3LFD5 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP41Q3LFD5 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP41Q3LFD5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP41Q3LFD5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP41Q3LFD5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP41Q3LFD5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
USP41Q3LFD5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP41Q3LFD5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
USP41Q3LFD5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP41Q3LFD5 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP41Q3LFD5 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP41Q3LFD5 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
USP41Q3LFD5 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP41Q3LFD5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP41Q3LFD5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP41Q3LFD5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
USP41Q3LFD5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP41Q3LFD5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP41Q3LFD5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP41Q3LFD5 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP41Q3LFD5 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP41Q3LFD5 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP41Q3LFD5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
USP41Q3LFD5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP41Q3LFD5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
USP41Q3LFD5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP41Q3LFD5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP41Q3LFD5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP41Q3LFD5 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
USP41Q3LFD5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP41Q3LFD5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP41Q3LFD5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
USP41Q3LFD5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP41Q3LFD5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP41Q3LFD5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP41Q3LFD5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP41Q3LFD5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP41Q3LFD5 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP41Q3LFD5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP41Q3LFD5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP41Q3LFD5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP41Q3LFD5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP41Q3LFD5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP41Q3LFD5 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP41Q3LFD5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP41Q3LFD5 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP41Q3LFD5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
USP41Q3LFD5 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP41Q3LFD5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP41Q3LFD5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP41Q3LFD5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP41Q3LFD5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP41Q3LFD5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP41Q3LFD5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP41Q3LFD5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP41Q3LFD5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP41Q3LFD5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP41Q3LFD5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP41Q3LFD5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP41Q3LFD5 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP41Q3LFD5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP41Q3LFD5 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP41Q3LFD5 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP41Q3LFD5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP41Q3LFD5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP41Q3LFD5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP41Q3LFD5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP41Q3LFD5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP41Q3LFD5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP41Q3LFD5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP41Q3LFD5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
USP41Q3LFD5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP41Q3LFD5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP41Q3LFD5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP41Q3LFD5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP41Q3LFD5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
USP41Q3LFD5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25■■□□□ 1.59
USP41Q3LFD5 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
USP41Q3LFD5 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
USP41Q3LFD5 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
USP41Q3LFD5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP41Q3LFD5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP41Q3LFD5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP41Q3LFD5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP41Q3LFD5 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP41Q3LFD5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP41Q3LFD5 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP41Q3LFD5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP41Q3LFD5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP41Q3LFD5 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP41Q3LFD5 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.4 ms