Protein–RNA interactions for Protein: Q30201

HFE, Hereditary hemochromatosis protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HFEQ30201 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HFEQ30201 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HFEQ30201 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HFEQ30201 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HFEQ30201 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HFEQ30201 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HFEQ30201 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HFEQ30201 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HFEQ30201 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HFEQ30201 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HFEQ30201 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HFEQ30201 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HFEQ30201 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HFEQ30201 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HFEQ30201 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HFEQ30201 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HFEQ30201 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HFEQ30201 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HFEQ30201 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
HFEQ30201 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HFEQ30201 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HFEQ30201 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HFEQ30201 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HFEQ30201 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HFEQ30201 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HFEQ30201 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HFEQ30201 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HFEQ30201 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HFEQ30201 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HFEQ30201 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HFEQ30201 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HFEQ30201 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HFEQ30201 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HFEQ30201 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HFEQ30201 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HFEQ30201 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HFEQ30201 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HFEQ30201 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HFEQ30201 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HFEQ30201 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HFEQ30201 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HFEQ30201 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HFEQ30201 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HFEQ30201 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HFEQ30201 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HFEQ30201 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HFEQ30201 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HFEQ30201 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HFEQ30201 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HFEQ30201 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HFEQ30201 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HFEQ30201 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HFEQ30201 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HFEQ30201 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HFEQ30201 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HFEQ30201 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HFEQ30201 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HFEQ30201 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HFEQ30201 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HFEQ30201 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HFEQ30201 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HFEQ30201 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HFEQ30201 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HFEQ30201 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HFEQ30201 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HFEQ30201 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HFEQ30201 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HFEQ30201 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HFEQ30201 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HFEQ30201 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HFEQ30201 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HFEQ30201 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HFEQ30201 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HFEQ30201 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HFEQ30201 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HFEQ30201 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HFEQ30201 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HFEQ30201 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HFEQ30201 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HFEQ30201 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HFEQ30201 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HFEQ30201 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
HFEQ30201 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HFEQ30201 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HFEQ30201 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HFEQ30201 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HFEQ30201 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HFEQ30201 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HFEQ30201 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HFEQ30201 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HFEQ30201 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HFEQ30201 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HFEQ30201 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HFEQ30201 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HFEQ30201 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HFEQ30201 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
HFEQ30201 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HFEQ30201 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HFEQ30201 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HFEQ30201 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms