Protein–RNA interactions for Protein: Q2Y0W8

SLC4A8, Electroneutral sodium bicarbonate exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A8Q2Y0W8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC4A8Q2Y0W8 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC4A8Q2Y0W8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC4A8Q2Y0W8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC4A8Q2Y0W8 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC4A8Q2Y0W8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC4A8Q2Y0W8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC4A8Q2Y0W8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC4A8Q2Y0W8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC4A8Q2Y0W8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC4A8Q2Y0W8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC4A8Q2Y0W8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC4A8Q2Y0W8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC4A8Q2Y0W8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC4A8Q2Y0W8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC4A8Q2Y0W8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC4A8Q2Y0W8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC4A8Q2Y0W8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC4A8Q2Y0W8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC4A8Q2Y0W8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC4A8Q2Y0W8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC4A8Q2Y0W8 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC4A8Q2Y0W8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC4A8Q2Y0W8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC4A8Q2Y0W8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC4A8Q2Y0W8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC4A8Q2Y0W8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC4A8Q2Y0W8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC4A8Q2Y0W8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC4A8Q2Y0W8 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC4A8Q2Y0W8 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC4A8Q2Y0W8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC4A8Q2Y0W8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC4A8Q2Y0W8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC4A8Q2Y0W8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC4A8Q2Y0W8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC4A8Q2Y0W8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC4A8Q2Y0W8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC4A8Q2Y0W8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC4A8Q2Y0W8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC4A8Q2Y0W8 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC4A8Q2Y0W8 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC4A8Q2Y0W8 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC4A8Q2Y0W8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC4A8Q2Y0W8 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC4A8Q2Y0W8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC4A8Q2Y0W8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC4A8Q2Y0W8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC4A8Q2Y0W8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC4A8Q2Y0W8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC4A8Q2Y0W8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SLC4A8Q2Y0W8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SLC4A8Q2Y0W8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
SLC4A8Q2Y0W8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SLC4A8Q2Y0W8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC4A8Q2Y0W8 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC4A8Q2Y0W8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC4A8Q2Y0W8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC4A8Q2Y0W8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC4A8Q2Y0W8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC4A8Q2Y0W8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC4A8Q2Y0W8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC4A8Q2Y0W8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC4A8Q2Y0W8 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC4A8Q2Y0W8 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC4A8Q2Y0W8 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC4A8Q2Y0W8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC4A8Q2Y0W8 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC4A8Q2Y0W8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC4A8Q2Y0W8 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC4A8Q2Y0W8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC4A8Q2Y0W8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC4A8Q2Y0W8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC4A8Q2Y0W8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC4A8Q2Y0W8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC4A8Q2Y0W8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC4A8Q2Y0W8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC4A8Q2Y0W8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC4A8Q2Y0W8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC4A8Q2Y0W8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC4A8Q2Y0W8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC4A8Q2Y0W8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC4A8Q2Y0W8 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC4A8Q2Y0W8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC4A8Q2Y0W8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC4A8Q2Y0W8 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC4A8Q2Y0W8 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC4A8Q2Y0W8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC4A8Q2Y0W8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC4A8Q2Y0W8 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC4A8Q2Y0W8 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC4A8Q2Y0W8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC4A8Q2Y0W8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC4A8Q2Y0W8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC4A8Q2Y0W8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC4A8Q2Y0W8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC4A8Q2Y0W8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC4A8Q2Y0W8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC4A8Q2Y0W8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC4A8Q2Y0W8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms