Protein–RNA interactions for Protein: Q2QD12

RPEL1, Ribulose-phosphate 3-epimerase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPEL1Q2QD12 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPEL1Q2QD12 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPEL1Q2QD12 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPEL1Q2QD12 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPEL1Q2QD12 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPEL1Q2QD12 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPEL1Q2QD12 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPEL1Q2QD12 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPEL1Q2QD12 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPEL1Q2QD12 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPEL1Q2QD12 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPEL1Q2QD12 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPEL1Q2QD12 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPEL1Q2QD12 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RPEL1Q2QD12 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPEL1Q2QD12 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPEL1Q2QD12 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPEL1Q2QD12 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPEL1Q2QD12 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPEL1Q2QD12 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPEL1Q2QD12 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPEL1Q2QD12 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPEL1Q2QD12 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPEL1Q2QD12 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPEL1Q2QD12 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RPEL1Q2QD12 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPEL1Q2QD12 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPEL1Q2QD12 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPEL1Q2QD12 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPEL1Q2QD12 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPEL1Q2QD12 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPEL1Q2QD12 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPEL1Q2QD12 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPEL1Q2QD12 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPEL1Q2QD12 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPEL1Q2QD12 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPEL1Q2QD12 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPEL1Q2QD12 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPEL1Q2QD12 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPEL1Q2QD12 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPEL1Q2QD12 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPEL1Q2QD12 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPEL1Q2QD12 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPEL1Q2QD12 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPEL1Q2QD12 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPEL1Q2QD12 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPEL1Q2QD12 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPEL1Q2QD12 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPEL1Q2QD12 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RPEL1Q2QD12 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPEL1Q2QD12 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPEL1Q2QD12 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPEL1Q2QD12 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPEL1Q2QD12 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPEL1Q2QD12 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPEL1Q2QD12 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RPEL1Q2QD12 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPEL1Q2QD12 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPEL1Q2QD12 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RPEL1Q2QD12 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPEL1Q2QD12 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RPEL1Q2QD12 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPEL1Q2QD12 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPEL1Q2QD12 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPEL1Q2QD12 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPEL1Q2QD12 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPEL1Q2QD12 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPEL1Q2QD12 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPEL1Q2QD12 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPEL1Q2QD12 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPEL1Q2QD12 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPEL1Q2QD12 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPEL1Q2QD12 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPEL1Q2QD12 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPEL1Q2QD12 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPEL1Q2QD12 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPEL1Q2QD12 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RPEL1Q2QD12 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPEL1Q2QD12 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPEL1Q2QD12 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPEL1Q2QD12 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPEL1Q2QD12 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPEL1Q2QD12 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPEL1Q2QD12 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RPEL1Q2QD12 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RPEL1Q2QD12 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPEL1Q2QD12 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPEL1Q2QD12 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPEL1Q2QD12 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RPEL1Q2QD12 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPEL1Q2QD12 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RPEL1Q2QD12 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPEL1Q2QD12 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPEL1Q2QD12 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPEL1Q2QD12 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPEL1Q2QD12 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPEL1Q2QD12 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPEL1Q2QD12 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPEL1Q2QD12 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPEL1Q2QD12 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms