Protein–RNA interactions for Protein: Q2Q1W2

TRIM71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 868 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM71Q2Q1W2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM71Q2Q1W2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM71Q2Q1W2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM71Q2Q1W2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM71Q2Q1W2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM71Q2Q1W2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM71Q2Q1W2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM71Q2Q1W2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM71Q2Q1W2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM71Q2Q1W2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM71Q2Q1W2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM71Q2Q1W2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM71Q2Q1W2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM71Q2Q1W2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM71Q2Q1W2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM71Q2Q1W2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM71Q2Q1W2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM71Q2Q1W2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM71Q2Q1W2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM71Q2Q1W2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM71Q2Q1W2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM71Q2Q1W2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM71Q2Q1W2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM71Q2Q1W2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM71Q2Q1W2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM71Q2Q1W2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM71Q2Q1W2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM71Q2Q1W2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM71Q2Q1W2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TRIM71Q2Q1W2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM71Q2Q1W2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM71Q2Q1W2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM71Q2Q1W2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM71Q2Q1W2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM71Q2Q1W2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM71Q2Q1W2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM71Q2Q1W2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM71Q2Q1W2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM71Q2Q1W2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM71Q2Q1W2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM71Q2Q1W2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM71Q2Q1W2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM71Q2Q1W2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM71Q2Q1W2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM71Q2Q1W2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM71Q2Q1W2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM71Q2Q1W2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM71Q2Q1W2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM71Q2Q1W2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM71Q2Q1W2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM71Q2Q1W2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM71Q2Q1W2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM71Q2Q1W2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM71Q2Q1W2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM71Q2Q1W2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM71Q2Q1W2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM71Q2Q1W2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM71Q2Q1W2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM71Q2Q1W2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM71Q2Q1W2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM71Q2Q1W2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM71Q2Q1W2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM71Q2Q1W2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM71Q2Q1W2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM71Q2Q1W2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM71Q2Q1W2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM71Q2Q1W2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM71Q2Q1W2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM71Q2Q1W2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TRIM71Q2Q1W2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
TRIM71Q2Q1W2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM71Q2Q1W2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM71Q2Q1W2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM71Q2Q1W2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM71Q2Q1W2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM71Q2Q1W2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM71Q2Q1W2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM71Q2Q1W2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM71Q2Q1W2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM71Q2Q1W2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM71Q2Q1W2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM71Q2Q1W2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM71Q2Q1W2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM71Q2Q1W2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM71Q2Q1W2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM71Q2Q1W2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM71Q2Q1W2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM71Q2Q1W2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM71Q2Q1W2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM71Q2Q1W2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM71Q2Q1W2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM71Q2Q1W2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM71Q2Q1W2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM71Q2Q1W2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM71Q2Q1W2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM71Q2Q1W2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM71Q2Q1W2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM71Q2Q1W2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM71Q2Q1W2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM71Q2Q1W2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.6 ms