Protein–RNA interactions for Protein: Q29980

MICB, MHC class I polypeptide-related sequence B, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICBQ29980 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MICBQ29980 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MICBQ29980 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MICBQ29980 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MICBQ29980 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MICBQ29980 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MICBQ29980 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MICBQ29980 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MICBQ29980 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MICBQ29980 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MICBQ29980 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MICBQ29980 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MICBQ29980 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MICBQ29980 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
MICBQ29980 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MICBQ29980 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MICBQ29980 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MICBQ29980 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MICBQ29980 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MICBQ29980 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MICBQ29980 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
MICBQ29980 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MICBQ29980 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MICBQ29980 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MICBQ29980 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MICBQ29980 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MICBQ29980 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MICBQ29980 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MICBQ29980 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MICBQ29980 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MICBQ29980 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MICBQ29980 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MICBQ29980 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MICBQ29980 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
MICBQ29980 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MICBQ29980 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MICBQ29980 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MICBQ29980 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MICBQ29980 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MICBQ29980 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MICBQ29980 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MICBQ29980 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MICBQ29980 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MICBQ29980 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
MICBQ29980 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MICBQ29980 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MICBQ29980 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MICBQ29980 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MICBQ29980 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MICBQ29980 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MICBQ29980 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MICBQ29980 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MICBQ29980 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MICBQ29980 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
MICBQ29980 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
MICBQ29980 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MICBQ29980 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MICBQ29980 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MICBQ29980 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MICBQ29980 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MICBQ29980 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MICBQ29980 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MICBQ29980 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MICBQ29980 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MICBQ29980 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MICBQ29980 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MICBQ29980 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MICBQ29980 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MICBQ29980 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MICBQ29980 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MICBQ29980 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MICBQ29980 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MICBQ29980 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MICBQ29980 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MICBQ29980 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MICBQ29980 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MICBQ29980 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MICBQ29980 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MICBQ29980 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MICBQ29980 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MICBQ29980 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MICBQ29980 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MICBQ29980 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MICBQ29980 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MICBQ29980 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MICBQ29980 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MICBQ29980 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
MICBQ29980 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MICBQ29980 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MICBQ29980 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MICBQ29980 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MICBQ29980 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MICBQ29980 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MICBQ29980 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MICBQ29980 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MICBQ29980 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
MICBQ29980 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MICBQ29980 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MICBQ29980 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MICBQ29980 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms