Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CSPP1Q1MSJ5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CSPP1Q1MSJ5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CSPP1Q1MSJ5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CSPP1Q1MSJ5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CSPP1Q1MSJ5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CSPP1Q1MSJ5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CSPP1Q1MSJ5 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CSPP1Q1MSJ5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CSPP1Q1MSJ5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CSPP1Q1MSJ5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CSPP1Q1MSJ5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CSPP1Q1MSJ5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CSPP1Q1MSJ5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CSPP1Q1MSJ5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CSPP1Q1MSJ5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CSPP1Q1MSJ5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CSPP1Q1MSJ5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CSPP1Q1MSJ5 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CSPP1Q1MSJ5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CSPP1Q1MSJ5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CSPP1Q1MSJ5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CSPP1Q1MSJ5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CSPP1Q1MSJ5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CSPP1Q1MSJ5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CSPP1Q1MSJ5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CSPP1Q1MSJ5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CSPP1Q1MSJ5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CSPP1Q1MSJ5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CSPP1Q1MSJ5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CSPP1Q1MSJ5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CSPP1Q1MSJ5 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CSPP1Q1MSJ5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CSPP1Q1MSJ5 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CSPP1Q1MSJ5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CSPP1Q1MSJ5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CSPP1Q1MSJ5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CSPP1Q1MSJ5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CSPP1Q1MSJ5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CSPP1Q1MSJ5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CSPP1Q1MSJ5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CSPP1Q1MSJ5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CSPP1Q1MSJ5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CSPP1Q1MSJ5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CSPP1Q1MSJ5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CSPP1Q1MSJ5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CSPP1Q1MSJ5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CSPP1Q1MSJ5 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CSPP1Q1MSJ5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CSPP1Q1MSJ5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CSPP1Q1MSJ5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CSPP1Q1MSJ5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CSPP1Q1MSJ5 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
CSPP1Q1MSJ5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
CSPP1Q1MSJ5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
CSPP1Q1MSJ5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CSPP1Q1MSJ5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CSPP1Q1MSJ5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CSPP1Q1MSJ5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CSPP1Q1MSJ5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CSPP1Q1MSJ5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CSPP1Q1MSJ5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CSPP1Q1MSJ5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CSPP1Q1MSJ5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CSPP1Q1MSJ5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CSPP1Q1MSJ5 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CSPP1Q1MSJ5 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CSPP1Q1MSJ5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CSPP1Q1MSJ5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CSPP1Q1MSJ5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CSPP1Q1MSJ5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CSPP1Q1MSJ5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CSPP1Q1MSJ5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CSPP1Q1MSJ5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CSPP1Q1MSJ5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CSPP1Q1MSJ5 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CSPP1Q1MSJ5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CSPP1Q1MSJ5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CSPP1Q1MSJ5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CSPP1Q1MSJ5 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CSPP1Q1MSJ5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CSPP1Q1MSJ5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CSPP1Q1MSJ5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CSPP1Q1MSJ5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CSPP1Q1MSJ5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CSPP1Q1MSJ5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CSPP1Q1MSJ5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CSPP1Q1MSJ5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CSPP1Q1MSJ5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CSPP1Q1MSJ5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CSPP1Q1MSJ5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CSPP1Q1MSJ5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CSPP1Q1MSJ5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CSPP1Q1MSJ5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CSPP1Q1MSJ5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CSPP1Q1MSJ5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CSPP1Q1MSJ5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CSPP1Q1MSJ5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CSPP1Q1MSJ5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CSPP1Q1MSJ5 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.4 ms