Protein–RNA interactions for Protein: Q1EHB4

SLC5A12, Sodium-coupled monocarboxylate transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A12Q1EHB4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC5A12Q1EHB4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC5A12Q1EHB4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC5A12Q1EHB4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC5A12Q1EHB4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC5A12Q1EHB4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC5A12Q1EHB4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC5A12Q1EHB4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC5A12Q1EHB4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC5A12Q1EHB4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC5A12Q1EHB4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC5A12Q1EHB4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC5A12Q1EHB4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC5A12Q1EHB4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC5A12Q1EHB4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC5A12Q1EHB4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC5A12Q1EHB4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC5A12Q1EHB4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC5A12Q1EHB4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC5A12Q1EHB4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC5A12Q1EHB4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC5A12Q1EHB4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC5A12Q1EHB4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC5A12Q1EHB4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC5A12Q1EHB4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC5A12Q1EHB4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC5A12Q1EHB4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC5A12Q1EHB4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC5A12Q1EHB4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC5A12Q1EHB4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC5A12Q1EHB4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC5A12Q1EHB4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC5A12Q1EHB4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC5A12Q1EHB4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC5A12Q1EHB4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC5A12Q1EHB4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC5A12Q1EHB4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC5A12Q1EHB4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC5A12Q1EHB4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC5A12Q1EHB4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC5A12Q1EHB4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC5A12Q1EHB4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC5A12Q1EHB4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC5A12Q1EHB4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC5A12Q1EHB4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC5A12Q1EHB4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC5A12Q1EHB4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC5A12Q1EHB4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC5A12Q1EHB4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC5A12Q1EHB4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC5A12Q1EHB4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC5A12Q1EHB4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC5A12Q1EHB4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC5A12Q1EHB4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC5A12Q1EHB4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC5A12Q1EHB4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC5A12Q1EHB4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC5A12Q1EHB4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC5A12Q1EHB4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC5A12Q1EHB4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC5A12Q1EHB4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC5A12Q1EHB4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC5A12Q1EHB4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC5A12Q1EHB4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC5A12Q1EHB4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC5A12Q1EHB4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC5A12Q1EHB4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC5A12Q1EHB4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC5A12Q1EHB4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC5A12Q1EHB4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC5A12Q1EHB4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC5A12Q1EHB4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC5A12Q1EHB4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC5A12Q1EHB4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC5A12Q1EHB4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC5A12Q1EHB4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC5A12Q1EHB4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC5A12Q1EHB4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC5A12Q1EHB4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC5A12Q1EHB4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC5A12Q1EHB4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC5A12Q1EHB4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC5A12Q1EHB4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC5A12Q1EHB4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC5A12Q1EHB4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC5A12Q1EHB4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC5A12Q1EHB4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC5A12Q1EHB4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC5A12Q1EHB4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC5A12Q1EHB4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC5A12Q1EHB4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC5A12Q1EHB4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC5A12Q1EHB4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC5A12Q1EHB4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC5A12Q1EHB4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC5A12Q1EHB4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC5A12Q1EHB4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC5A12Q1EHB4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC5A12Q1EHB4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC5A12Q1EHB4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms